Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PpifQ99KR7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms