Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ5

Tcf19, Transcription factor 19-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf19Q99KJ5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tcf19Q99KJ5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tcf19Q99KJ5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tcf19Q99KJ5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tcf19Q99KJ5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tcf19Q99KJ5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tcf19Q99KJ5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tcf19Q99KJ5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tcf19Q99KJ5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tcf19Q99KJ5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tcf19Q99KJ5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tcf19Q99KJ5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tcf19Q99KJ5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tcf19Q99KJ5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tcf19Q99KJ5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tcf19Q99KJ5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tcf19Q99KJ5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tcf19Q99KJ5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tcf19Q99KJ5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tcf19Q99KJ5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tcf19Q99KJ5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tcf19Q99KJ5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tcf19Q99KJ5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tcf19Q99KJ5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tcf19Q99KJ5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tcf19Q99KJ5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tcf19Q99KJ5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tcf19Q99KJ5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tcf19Q99KJ5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tcf19Q99KJ5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tcf19Q99KJ5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tcf19Q99KJ5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tcf19Q99KJ5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tcf19Q99KJ5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tcf19Q99KJ5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tcf19Q99KJ5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tcf19Q99KJ5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Tcf19Q99KJ5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tcf19Q99KJ5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tcf19Q99KJ5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Tcf19Q99KJ5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tcf19Q99KJ5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tcf19Q99KJ5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tcf19Q99KJ5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tcf19Q99KJ5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tcf19Q99KJ5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tcf19Q99KJ5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tcf19Q99KJ5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Tcf19Q99KJ5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tcf19Q99KJ5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tcf19Q99KJ5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Tcf19Q99KJ5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tcf19Q99KJ5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tcf19Q99KJ5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tcf19Q99KJ5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tcf19Q99KJ5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tcf19Q99KJ5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tcf19Q99KJ5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tcf19Q99KJ5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tcf19Q99KJ5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tcf19Q99KJ5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tcf19Q99KJ5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tcf19Q99KJ5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tcf19Q99KJ5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tcf19Q99KJ5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tcf19Q99KJ5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tcf19Q99KJ5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tcf19Q99KJ5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tcf19Q99KJ5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tcf19Q99KJ5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tcf19Q99KJ5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tcf19Q99KJ5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tcf19Q99KJ5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tcf19Q99KJ5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tcf19Q99KJ5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tcf19Q99KJ5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tcf19Q99KJ5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tcf19Q99KJ5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tcf19Q99KJ5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tcf19Q99KJ5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tcf19Q99KJ5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tcf19Q99KJ5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tcf19Q99KJ5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tcf19Q99KJ5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tcf19Q99KJ5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tcf19Q99KJ5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tcf19Q99KJ5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tcf19Q99KJ5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tcf19Q99KJ5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tcf19Q99KJ5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tcf19Q99KJ5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tcf19Q99KJ5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tcf19Q99KJ5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tcf19Q99KJ5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tcf19Q99KJ5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tcf19Q99KJ5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tcf19Q99KJ5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tcf19Q99KJ5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tcf19Q99KJ5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tcf19Q99KJ5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms