Protein–RNA interactions for Protein: Q99K23

Ufsp2, Ufm1-specific protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufsp2Q99K23 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ufsp2Q99K23 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ufsp2Q99K23 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ufsp2Q99K23 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ufsp2Q99K23 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ufsp2Q99K23 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ufsp2Q99K23 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ufsp2Q99K23 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ufsp2Q99K23 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ufsp2Q99K23 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ufsp2Q99K23 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ufsp2Q99K23 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ufsp2Q99K23 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ufsp2Q99K23 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ufsp2Q99K23 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ufsp2Q99K23 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ufsp2Q99K23 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ufsp2Q99K23 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ufsp2Q99K23 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ufsp2Q99K23 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms