Protein–RNA interactions for Protein: Q99K01

Pdxdc1, Pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdxdc1Q99K01 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdxdc1Q99K01 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdxdc1Q99K01 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdxdc1Q99K01 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdxdc1Q99K01 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdxdc1Q99K01 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdxdc1Q99K01 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdxdc1Q99K01 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdxdc1Q99K01 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdxdc1Q99K01 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdxdc1Q99K01 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdxdc1Q99K01 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdxdc1Q99K01 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdxdc1Q99K01 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdxdc1Q99K01 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdxdc1Q99K01 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdxdc1Q99K01 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdxdc1Q99K01 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdxdc1Q99K01 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdxdc1Q99K01 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdxdc1Q99K01 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdxdc1Q99K01 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdxdc1Q99K01 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdxdc1Q99K01 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdxdc1Q99K01 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdxdc1Q99K01 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdxdc1Q99K01 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdxdc1Q99K01 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdxdc1Q99K01 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdxdc1Q99K01 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdxdc1Q99K01 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdxdc1Q99K01 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdxdc1Q99K01 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdxdc1Q99K01 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdxdc1Q99K01 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdxdc1Q99K01 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdxdc1Q99K01 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdxdc1Q99K01 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdxdc1Q99K01 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdxdc1Q99K01 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdxdc1Q99K01 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdxdc1Q99K01 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdxdc1Q99K01 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdxdc1Q99K01 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdxdc1Q99K01 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdxdc1Q99K01 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdxdc1Q99K01 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdxdc1Q99K01 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdxdc1Q99K01 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdxdc1Q99K01 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdxdc1Q99K01 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdxdc1Q99K01 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdxdc1Q99K01 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdxdc1Q99K01 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdxdc1Q99K01 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdxdc1Q99K01 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Pdxdc1Q99K01 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pdxdc1Q99K01 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pdxdc1Q99K01 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pdxdc1Q99K01 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pdxdc1Q99K01 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdxdc1Q99K01 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdxdc1Q99K01 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdxdc1Q99K01 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdxdc1Q99K01 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pdxdc1Q99K01 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdxdc1Q99K01 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pdxdc1Q99K01 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdxdc1Q99K01 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdxdc1Q99K01 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdxdc1Q99K01 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pdxdc1Q99K01 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdxdc1Q99K01 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdxdc1Q99K01 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdxdc1Q99K01 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdxdc1Q99K01 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pdxdc1Q99K01 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdxdc1Q99K01 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdxdc1Q99K01 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdxdc1Q99K01 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdxdc1Q99K01 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdxdc1Q99K01 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdxdc1Q99K01 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdxdc1Q99K01 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Pdxdc1Q99K01 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdxdc1Q99K01 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Pdxdc1Q99K01 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdxdc1Q99K01 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdxdc1Q99K01 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Pdxdc1Q99K01 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdxdc1Q99K01 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdxdc1Q99K01 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdxdc1Q99K01 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pdxdc1Q99K01 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdxdc1Q99K01 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdxdc1Q99K01 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdxdc1Q99K01 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pdxdc1Q99K01 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Pdxdc1Q99K01 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Pdxdc1Q99K01 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms