Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Higd1bQ99JY6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Higd1bQ99JY6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Higd1bQ99JY6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Higd1bQ99JY6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Higd1bQ99JY6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Higd1bQ99JY6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Higd1bQ99JY6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Higd1bQ99JY6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Higd1bQ99JY6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Higd1bQ99JY6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Higd1bQ99JY6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Higd1bQ99JY6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Higd1bQ99JY6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Higd1bQ99JY6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Higd1bQ99JY6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Higd1bQ99JY6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Higd1bQ99JY6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Higd1bQ99JY6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Higd1bQ99JY6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Higd1bQ99JY6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Higd1bQ99JY6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Higd1bQ99JY6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Higd1bQ99JY6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Higd1bQ99JY6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Higd1bQ99JY6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Higd1bQ99JY6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Higd1bQ99JY6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Higd1bQ99JY6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Higd1bQ99JY6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Higd1bQ99JY6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Higd1bQ99JY6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Higd1bQ99JY6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Higd1bQ99JY6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Higd1bQ99JY6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Higd1bQ99JY6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Higd1bQ99JY6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Higd1bQ99JY6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Higd1bQ99JY6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Higd1bQ99JY6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Higd1bQ99JY6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Higd1bQ99JY6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Higd1bQ99JY6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Higd1bQ99JY6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Higd1bQ99JY6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Higd1bQ99JY6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Higd1bQ99JY6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Higd1bQ99JY6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Higd1bQ99JY6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Higd1bQ99JY6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Higd1bQ99JY6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Higd1bQ99JY6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Higd1bQ99JY6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Higd1bQ99JY6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Higd1bQ99JY6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Higd1bQ99JY6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Higd1bQ99JY6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Higd1bQ99JY6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Higd1bQ99JY6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Higd1bQ99JY6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Higd1bQ99JY6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Higd1bQ99JY6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Higd1bQ99JY6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Higd1bQ99JY6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Higd1bQ99JY6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Higd1bQ99JY6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Higd1bQ99JY6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Higd1bQ99JY6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Higd1bQ99JY6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Higd1bQ99JY6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Higd1bQ99JY6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Higd1bQ99JY6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Higd1bQ99JY6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Higd1bQ99JY6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Higd1bQ99JY6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Higd1bQ99JY6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Higd1bQ99JY6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Higd1bQ99JY6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Higd1bQ99JY6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Higd1bQ99JY6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Higd1bQ99JY6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Higd1bQ99JY6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Higd1bQ99JY6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Higd1bQ99JY6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Higd1bQ99JY6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Higd1bQ99JY6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Higd1bQ99JY6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Higd1bQ99JY6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Higd1bQ99JY6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Higd1bQ99JY6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Higd1bQ99JY6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Higd1bQ99JY6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Higd1bQ99JY6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Higd1bQ99JY6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Higd1bQ99JY6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Higd1bQ99JY6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Higd1bQ99JY6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Higd1bQ99JY6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Higd1bQ99JY6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Higd1bQ99JY6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms