Protein–RNA interactions for Protein: Q99JH7

Clstn3, Calsyntenin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn3Q99JH7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Clstn3Q99JH7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clstn3Q99JH7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clstn3Q99JH7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clstn3Q99JH7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clstn3Q99JH7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clstn3Q99JH7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clstn3Q99JH7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clstn3Q99JH7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clstn3Q99JH7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clstn3Q99JH7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clstn3Q99JH7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clstn3Q99JH7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clstn3Q99JH7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clstn3Q99JH7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clstn3Q99JH7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Clstn3Q99JH7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clstn3Q99JH7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Clstn3Q99JH7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Clstn3Q99JH7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clstn3Q99JH7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clstn3Q99JH7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Clstn3Q99JH7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clstn3Q99JH7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clstn3Q99JH7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clstn3Q99JH7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Clstn3Q99JH7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Clstn3Q99JH7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Clstn3Q99JH7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clstn3Q99JH7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clstn3Q99JH7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clstn3Q99JH7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clstn3Q99JH7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clstn3Q99JH7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clstn3Q99JH7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clstn3Q99JH7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clstn3Q99JH7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Clstn3Q99JH7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clstn3Q99JH7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clstn3Q99JH7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clstn3Q99JH7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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Clstn3Q99JH7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Clstn3Q99JH7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clstn3Q99JH7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clstn3Q99JH7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Clstn3Q99JH7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Clstn3Q99JH7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Clstn3Q99JH7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
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Clstn3Q99JH7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clstn3Q99JH7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clstn3Q99JH7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clstn3Q99JH7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clstn3Q99JH7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clstn3Q99JH7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clstn3Q99JH7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clstn3Q99JH7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clstn3Q99JH7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clstn3Q99JH7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clstn3Q99JH7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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Clstn3Q99JH7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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Clstn3Q99JH7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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Clstn3Q99JH7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Clstn3Q99JH7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Clstn3Q99JH7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clstn3Q99JH7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clstn3Q99JH7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clstn3Q99JH7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clstn3Q99JH7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clstn3Q99JH7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clstn3Q99JH7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clstn3Q99JH7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clstn3Q99JH7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clstn3Q99JH7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clstn3Q99JH7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clstn3Q99JH7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clstn3Q99JH7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clstn3Q99JH7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clstn3Q99JH7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clstn3Q99JH7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clstn3Q99JH7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clstn3Q99JH7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clstn3Q99JH7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clstn3Q99JH7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clstn3Q99JH7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clstn3Q99JH7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clstn3Q99JH7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clstn3Q99JH7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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