Protein–RNA interactions for Protein: Q99J83

Atg5, Autophagy protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg5Q99J83 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atg5Q99J83 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg5Q99J83 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atg5Q99J83 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atg5Q99J83 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atg5Q99J83 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms