Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctu1Q99J10 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctu1Q99J10 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctu1Q99J10 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctu1Q99J10 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctu1Q99J10 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctu1Q99J10 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctu1Q99J10 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctu1Q99J10 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctu1Q99J10 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctu1Q99J10 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctu1Q99J10 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctu1Q99J10 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctu1Q99J10 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctu1Q99J10 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctu1Q99J10 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctu1Q99J10 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctu1Q99J10 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctu1Q99J10 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctu1Q99J10 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctu1Q99J10 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctu1Q99J10 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctu1Q99J10 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctu1Q99J10 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctu1Q99J10 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctu1Q99J10 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctu1Q99J10 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctu1Q99J10 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctu1Q99J10 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctu1Q99J10 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ctu1Q99J10 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctu1Q99J10 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctu1Q99J10 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctu1Q99J10 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctu1Q99J10 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctu1Q99J10 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctu1Q99J10 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctu1Q99J10 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctu1Q99J10 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctu1Q99J10 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctu1Q99J10 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctu1Q99J10 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctu1Q99J10 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctu1Q99J10 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctu1Q99J10 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctu1Q99J10 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctu1Q99J10 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctu1Q99J10 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctu1Q99J10 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctu1Q99J10 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctu1Q99J10 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctu1Q99J10 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctu1Q99J10 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctu1Q99J10 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctu1Q99J10 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctu1Q99J10 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctu1Q99J10 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctu1Q99J10 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctu1Q99J10 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctu1Q99J10 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctu1Q99J10 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctu1Q99J10 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctu1Q99J10 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctu1Q99J10 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctu1Q99J10 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctu1Q99J10 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctu1Q99J10 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctu1Q99J10 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctu1Q99J10 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctu1Q99J10 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctu1Q99J10 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctu1Q99J10 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctu1Q99J10 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctu1Q99J10 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctu1Q99J10 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctu1Q99J10 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctu1Q99J10 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctu1Q99J10 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctu1Q99J10 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctu1Q99J10 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctu1Q99J10 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctu1Q99J10 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctu1Q99J10 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctu1Q99J10 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctu1Q99J10 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctu1Q99J10 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctu1Q99J10 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctu1Q99J10 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctu1Q99J10 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctu1Q99J10 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctu1Q99J10 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctu1Q99J10 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctu1Q99J10 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctu1Q99J10 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctu1Q99J10 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctu1Q99J10 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctu1Q99J10 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctu1Q99J10 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctu1Q99J10 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctu1Q99J10 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms