Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn16Q925N4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn16Q925N4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn16Q925N4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn16Q925N4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn16Q925N4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn16Q925N4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn16Q925N4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn16Q925N4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn16Q925N4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn16Q925N4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn16Q925N4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn16Q925N4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn16Q925N4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn16Q925N4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn16Q925N4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn16Q925N4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn16Q925N4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn16Q925N4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn16Q925N4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn16Q925N4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn16Q925N4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn16Q925N4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn16Q925N4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn16Q925N4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn16Q925N4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn16Q925N4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn16Q925N4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn16Q925N4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn16Q925N4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn16Q925N4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn16Q925N4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn16Q925N4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn16Q925N4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Cldn16Q925N4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn16Q925N4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn16Q925N4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn16Q925N4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn16Q925N4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn16Q925N4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn16Q925N4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn16Q925N4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn16Q925N4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn16Q925N4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn16Q925N4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn16Q925N4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn16Q925N4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn16Q925N4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn16Q925N4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Cldn16Q925N4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn16Q925N4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn16Q925N4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn16Q925N4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn16Q925N4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn16Q925N4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Cldn16Q925N4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Cldn16Q925N4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Cldn16Q925N4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Cldn16Q925N4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn16Q925N4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn16Q925N4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn16Q925N4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn16Q925N4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Cldn16Q925N4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn16Q925N4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn16Q925N4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Cldn16Q925N4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn16Q925N4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn16Q925N4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn16Q925N4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn16Q925N4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn16Q925N4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn16Q925N4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn16Q925N4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn16Q925N4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn16Q925N4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn16Q925N4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn16Q925N4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn16Q925N4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn16Q925N4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn16Q925N4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn16Q925N4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn16Q925N4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn16Q925N4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn16Q925N4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn16Q925N4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn16Q925N4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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