Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sf3b5Q923D4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3b5Q923D4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3b5Q923D4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3b5Q923D4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3b5Q923D4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3b5Q923D4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3b5Q923D4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3b5Q923D4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3b5Q923D4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3b5Q923D4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3b5Q923D4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3b5Q923D4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3b5Q923D4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b5Q923D4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b5Q923D4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b5Q923D4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b5Q923D4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b5Q923D4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b5Q923D4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b5Q923D4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b5Q923D4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b5Q923D4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b5Q923D4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b5Q923D4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b5Q923D4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b5Q923D4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3b5Q923D4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b5Q923D4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b5Q923D4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b5Q923D4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b5Q923D4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b5Q923D4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b5Q923D4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b5Q923D4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b5Q923D4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b5Q923D4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b5Q923D4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b5Q923D4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b5Q923D4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b5Q923D4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b5Q923D4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b5Q923D4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b5Q923D4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b5Q923D4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b5Q923D4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b5Q923D4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b5Q923D4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b5Q923D4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b5Q923D4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b5Q923D4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b5Q923D4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3b5Q923D4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3b5Q923D4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3b5Q923D4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3b5Q923D4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3b5Q923D4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3b5Q923D4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3b5Q923D4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3b5Q923D4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3b5Q923D4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sf3b5Q923D4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b5Q923D4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b5Q923D4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b5Q923D4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b5Q923D4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b5Q923D4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b5Q923D4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b5Q923D4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b5Q923D4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b5Q923D4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b5Q923D4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b5Q923D4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b5Q923D4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b5Q923D4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b5Q923D4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b5Q923D4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms