Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tubb6Q922F4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tubb6Q922F4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tubb6Q922F4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tubb6Q922F4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tubb6Q922F4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tubb6Q922F4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tubb6Q922F4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tubb6Q922F4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tubb6Q922F4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tubb6Q922F4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tubb6Q922F4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tubb6Q922F4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tubb6Q922F4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tubb6Q922F4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tubb6Q922F4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tubb6Q922F4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tubb6Q922F4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tubb6Q922F4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tubb6Q922F4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tubb6Q922F4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tubb6Q922F4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tubb6Q922F4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tubb6Q922F4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tubb6Q922F4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tubb6Q922F4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tubb6Q922F4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tubb6Q922F4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tubb6Q922F4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tubb6Q922F4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tubb6Q922F4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tubb6Q922F4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tubb6Q922F4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tubb6Q922F4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tubb6Q922F4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tubb6Q922F4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tubb6Q922F4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tubb6Q922F4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tubb6Q922F4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tubb6Q922F4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tubb6Q922F4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tubb6Q922F4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tubb6Q922F4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tubb6Q922F4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tubb6Q922F4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tubb6Q922F4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tubb6Q922F4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tubb6Q922F4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tubb6Q922F4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tubb6Q922F4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tubb6Q922F4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tubb6Q922F4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tubb6Q922F4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Tubb6Q922F4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tubb6Q922F4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tubb6Q922F4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tubb6Q922F4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tubb6Q922F4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tubb6Q922F4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tubb6Q922F4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tubb6Q922F4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tubb6Q922F4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tubb6Q922F4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tubb6Q922F4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tubb6Q922F4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tubb6Q922F4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tubb6Q922F4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tubb6Q922F4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tubb6Q922F4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tubb6Q922F4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tubb6Q922F4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tubb6Q922F4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tubb6Q922F4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tubb6Q922F4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Tubb6Q922F4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tubb6Q922F4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tubb6Q922F4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tubb6Q922F4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tubb6Q922F4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tubb6Q922F4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tubb6Q922F4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tubb6Q922F4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tubb6Q922F4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tubb6Q922F4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tubb6Q922F4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tubb6Q922F4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tubb6Q922F4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tubb6Q922F4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tubb6Q922F4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tubb6Q922F4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tubb6Q922F4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tubb6Q922F4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tubb6Q922F4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tubb6Q922F4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tubb6Q922F4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tubb6Q922F4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tubb6Q922F4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tubb6Q922F4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tubb6Q922F4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tubb6Q922F4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms