Protein–RNA interactions for Protein: Q922B6

Traf7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf7Q922B6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Traf7Q922B6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Traf7Q922B6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Traf7Q922B6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Traf7Q922B6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Traf7Q922B6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Traf7Q922B6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Traf7Q922B6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Traf7Q922B6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Traf7Q922B6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Traf7Q922B6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Traf7Q922B6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Traf7Q922B6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Traf7Q922B6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Traf7Q922B6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Traf7Q922B6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Traf7Q922B6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Traf7Q922B6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Traf7Q922B6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Traf7Q922B6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Traf7Q922B6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Traf7Q922B6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Traf7Q922B6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Traf7Q922B6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Traf7Q922B6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Traf7Q922B6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Traf7Q922B6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Traf7Q922B6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Traf7Q922B6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Traf7Q922B6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Traf7Q922B6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Traf7Q922B6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Traf7Q922B6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Traf7Q922B6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Traf7Q922B6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Traf7Q922B6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Traf7Q922B6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Traf7Q922B6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Traf7Q922B6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Traf7Q922B6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Traf7Q922B6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Traf7Q922B6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Traf7Q922B6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Traf7Q922B6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Traf7Q922B6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Traf7Q922B6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Traf7Q922B6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Traf7Q922B6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Traf7Q922B6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Traf7Q922B6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Traf7Q922B6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Traf7Q922B6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Traf7Q922B6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Traf7Q922B6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Traf7Q922B6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Traf7Q922B6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Traf7Q922B6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Traf7Q922B6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Traf7Q922B6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Traf7Q922B6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Traf7Q922B6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Traf7Q922B6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Traf7Q922B6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Traf7Q922B6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Traf7Q922B6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Traf7Q922B6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Traf7Q922B6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Traf7Q922B6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Traf7Q922B6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Traf7Q922B6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Traf7Q922B6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Traf7Q922B6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Traf7Q922B6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Traf7Q922B6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Traf7Q922B6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Traf7Q922B6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Traf7Q922B6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Traf7Q922B6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Traf7Q922B6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Traf7Q922B6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Traf7Q922B6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Traf7Q922B6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Traf7Q922B6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Traf7Q922B6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Traf7Q922B6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Traf7Q922B6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Traf7Q922B6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Traf7Q922B6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Traf7Q922B6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Traf7Q922B6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Traf7Q922B6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Traf7Q922B6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Traf7Q922B6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Traf7Q922B6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Traf7Q922B6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Traf7Q922B6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Traf7Q922B6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Traf7Q922B6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Traf7Q922B6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Traf7Q922B6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms