Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sh3bp4Q921I6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sh3bp4Q921I6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sh3bp4Q921I6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sh3bp4Q921I6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sh3bp4Q921I6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sh3bp4Q921I6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sh3bp4Q921I6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sh3bp4Q921I6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sh3bp4Q921I6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sh3bp4Q921I6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sh3bp4Q921I6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sh3bp4Q921I6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sh3bp4Q921I6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sh3bp4Q921I6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sh3bp4Q921I6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Sh3bp4Q921I6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sh3bp4Q921I6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Sh3bp4Q921I6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sh3bp4Q921I6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sh3bp4Q921I6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sh3bp4Q921I6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh3bp4Q921I6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh3bp4Q921I6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh3bp4Q921I6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh3bp4Q921I6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh3bp4Q921I6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh3bp4Q921I6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh3bp4Q921I6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh3bp4Q921I6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh3bp4Q921I6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh3bp4Q921I6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms