Protein–RNA interactions for Protein: Q920Q6

Msi2, RNA-binding protein Musashi homolog 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi2Q920Q6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Msi2Q920Q6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Msi2Q920Q6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Msi2Q920Q6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Msi2Q920Q6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Msi2Q920Q6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Msi2Q920Q6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Msi2Q920Q6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Msi2Q920Q6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Msi2Q920Q6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Msi2Q920Q6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Msi2Q920Q6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Msi2Q920Q6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Msi2Q920Q6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Msi2Q920Q6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Msi2Q920Q6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Msi2Q920Q6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Msi2Q920Q6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Msi2Q920Q6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Msi2Q920Q6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Msi2Q920Q6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Msi2Q920Q6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Msi2Q920Q6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Msi2Q920Q6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Msi2Q920Q6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Msi2Q920Q6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Msi2Q920Q6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Msi2Q920Q6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Msi2Q920Q6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Msi2Q920Q6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Msi2Q920Q6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Msi2Q920Q6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Msi2Q920Q6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Msi2Q920Q6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Msi2Q920Q6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Msi2Q920Q6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Msi2Q920Q6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Msi2Q920Q6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Msi2Q920Q6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Msi2Q920Q6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Msi2Q920Q6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Msi2Q920Q6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Msi2Q920Q6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Msi2Q920Q6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Msi2Q920Q6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Msi2Q920Q6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Msi2Q920Q6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Msi2Q920Q6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Msi2Q920Q6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Msi2Q920Q6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Msi2Q920Q6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Msi2Q920Q6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Msi2Q920Q6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Msi2Q920Q6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Msi2Q920Q6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Msi2Q920Q6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Msi2Q920Q6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Msi2Q920Q6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Msi2Q920Q6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msi2Q920Q6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msi2Q920Q6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msi2Q920Q6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msi2Q920Q6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msi2Q920Q6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msi2Q920Q6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msi2Q920Q6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msi2Q920Q6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msi2Q920Q6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msi2Q920Q6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msi2Q920Q6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msi2Q920Q6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msi2Q920Q6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msi2Q920Q6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msi2Q920Q6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msi2Q920Q6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msi2Q920Q6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msi2Q920Q6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msi2Q920Q6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msi2Q920Q6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msi2Q920Q6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msi2Q920Q6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msi2Q920Q6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msi2Q920Q6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msi2Q920Q6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msi2Q920Q6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Msi2Q920Q6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msi2Q920Q6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msi2Q920Q6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msi2Q920Q6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msi2Q920Q6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msi2Q920Q6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msi2Q920Q6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msi2Q920Q6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msi2Q920Q6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Msi2Q920Q6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msi2Q920Q6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Msi2Q920Q6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msi2Q920Q6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msi2Q920Q6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msi2Q920Q6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms