Protein–RNA interactions for Protein: Q91YU3

Msantd4, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msantd4Q91YU3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msantd4Q91YU3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msantd4Q91YU3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Msantd4Q91YU3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Msantd4Q91YU3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Msantd4Q91YU3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Msantd4Q91YU3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Msantd4Q91YU3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Msantd4Q91YU3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Msantd4Q91YU3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Msantd4Q91YU3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Msantd4Q91YU3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Msantd4Q91YU3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Msantd4Q91YU3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Msantd4Q91YU3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Msantd4Q91YU3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Msantd4Q91YU3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Msantd4Q91YU3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Msantd4Q91YU3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Msantd4Q91YU3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Msantd4Q91YU3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Msantd4Q91YU3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Msantd4Q91YU3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Msantd4Q91YU3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Msantd4Q91YU3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Msantd4Q91YU3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Msantd4Q91YU3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Msantd4Q91YU3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Msantd4Q91YU3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Msantd4Q91YU3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Msantd4Q91YU3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Msantd4Q91YU3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Msantd4Q91YU3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Msantd4Q91YU3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Msantd4Q91YU3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Msantd4Q91YU3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Msantd4Q91YU3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Msantd4Q91YU3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Msantd4Q91YU3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Msantd4Q91YU3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Msantd4Q91YU3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Msantd4Q91YU3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Msantd4Q91YU3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Msantd4Q91YU3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Msantd4Q91YU3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Msantd4Q91YU3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Msantd4Q91YU3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Msantd4Q91YU3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Msantd4Q91YU3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Msantd4Q91YU3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Msantd4Q91YU3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Msantd4Q91YU3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Msantd4Q91YU3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Msantd4Q91YU3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Msantd4Q91YU3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Msantd4Q91YU3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Msantd4Q91YU3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Msantd4Q91YU3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Msantd4Q91YU3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Msantd4Q91YU3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Msantd4Q91YU3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Msantd4Q91YU3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Msantd4Q91YU3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Msantd4Q91YU3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Msantd4Q91YU3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Msantd4Q91YU3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Msantd4Q91YU3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Msantd4Q91YU3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Msantd4Q91YU3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Msantd4Q91YU3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Msantd4Q91YU3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Msantd4Q91YU3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Msantd4Q91YU3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Msantd4Q91YU3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Msantd4Q91YU3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Msantd4Q91YU3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Msantd4Q91YU3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Msantd4Q91YU3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Msantd4Q91YU3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Msantd4Q91YU3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msantd4Q91YU3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msantd4Q91YU3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msantd4Q91YU3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msantd4Q91YU3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msantd4Q91YU3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msantd4Q91YU3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msantd4Q91YU3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msantd4Q91YU3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msantd4Q91YU3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msantd4Q91YU3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msantd4Q91YU3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Msantd4Q91YU3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Msantd4Q91YU3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Msantd4Q91YU3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Msantd4Q91YU3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Msantd4Q91YU3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Msantd4Q91YU3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Msantd4Q91YU3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Msantd4Q91YU3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Msantd4Q91YU3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms