Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK0

Lrrc49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc49Q91YK0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc49Q91YK0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc49Q91YK0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc49Q91YK0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc49Q91YK0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc49Q91YK0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc49Q91YK0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc49Q91YK0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc49Q91YK0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrc49Q91YK0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc49Q91YK0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc49Q91YK0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc49Q91YK0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc49Q91YK0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc49Q91YK0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc49Q91YK0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc49Q91YK0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc49Q91YK0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc49Q91YK0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc49Q91YK0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrc49Q91YK0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lrrc49Q91YK0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrrc49Q91YK0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc49Q91YK0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc49Q91YK0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc49Q91YK0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc49Q91YK0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc49Q91YK0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrrc49Q91YK0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc49Q91YK0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc49Q91YK0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrrc49Q91YK0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms