Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y13

Pcdha7, Protocadherin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha7Q91Y13 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcdha7Q91Y13 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcdha7Q91Y13 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pcdha7Q91Y13 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pcdha7Q91Y13 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pcdha7Q91Y13 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pcdha7Q91Y13 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdha7Q91Y13 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdha7Q91Y13 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdha7Q91Y13 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdha7Q91Y13 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdha7Q91Y13 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdha7Q91Y13 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdha7Q91Y13 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdha7Q91Y13 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdha7Q91Y13 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdha7Q91Y13 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdha7Q91Y13 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdha7Q91Y13 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdha7Q91Y13 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdha7Q91Y13 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdha7Q91Y13 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdha7Q91Y13 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdha7Q91Y13 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdha7Q91Y13 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdha7Q91Y13 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdha7Q91Y13 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdha7Q91Y13 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdha7Q91Y13 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdha7Q91Y13 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdha7Q91Y13 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdha7Q91Y13 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdha7Q91Y13 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdha7Q91Y13 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdha7Q91Y13 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdha7Q91Y13 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdha7Q91Y13 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdha7Q91Y13 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdha7Q91Y13 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdha7Q91Y13 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdha7Q91Y13 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdha7Q91Y13 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdha7Q91Y13 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdha7Q91Y13 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdha7Q91Y13 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdha7Q91Y13 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdha7Q91Y13 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdha7Q91Y13 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdha7Q91Y13 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdha7Q91Y13 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdha7Q91Y13 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdha7Q91Y13 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdha7Q91Y13 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdha7Q91Y13 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdha7Q91Y13 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdha7Q91Y13 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdha7Q91Y13 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdha7Q91Y13 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdha7Q91Y13 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdha7Q91Y13 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdha7Q91Y13 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdha7Q91Y13 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdha7Q91Y13 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdha7Q91Y13 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdha7Q91Y13 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdha7Q91Y13 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdha7Q91Y13 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdha7Q91Y13 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdha7Q91Y13 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdha7Q91Y13 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdha7Q91Y13 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdha7Q91Y13 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdha7Q91Y13 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdha7Q91Y13 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdha7Q91Y13 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdha7Q91Y13 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdha7Q91Y13 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdha7Q91Y13 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdha7Q91Y13 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdha7Q91Y13 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdha7Q91Y13 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdha7Q91Y13 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdha7Q91Y13 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcdha7Q91Y13 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdha7Q91Y13 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdha7Q91Y13 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdha7Q91Y13 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcdha7Q91Y13 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdha7Q91Y13 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdha7Q91Y13 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdha7Q91Y13 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdha7Q91Y13 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdha7Q91Y13 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdha7Q91Y13 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdha7Q91Y13 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdha7Q91Y13 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdha7Q91Y13 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdha7Q91Y13 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdha7Q91Y13 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcdha7Q91Y13 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms