Protein–RNA interactions for Protein: Q91WU4

Tmco4, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco4Q91WU4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmco4Q91WU4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmco4Q91WU4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmco4Q91WU4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmco4Q91WU4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmco4Q91WU4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmco4Q91WU4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmco4Q91WU4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmco4Q91WU4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmco4Q91WU4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmco4Q91WU4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmco4Q91WU4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmco4Q91WU4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmco4Q91WU4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmco4Q91WU4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmco4Q91WU4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmco4Q91WU4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmco4Q91WU4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmco4Q91WU4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmco4Q91WU4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmco4Q91WU4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmco4Q91WU4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmco4Q91WU4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmco4Q91WU4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmco4Q91WU4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmco4Q91WU4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmco4Q91WU4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmco4Q91WU4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmco4Q91WU4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmco4Q91WU4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmco4Q91WU4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmco4Q91WU4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmco4Q91WU4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmco4Q91WU4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmco4Q91WU4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmco4Q91WU4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmco4Q91WU4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmco4Q91WU4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmco4Q91WU4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmco4Q91WU4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmco4Q91WU4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmco4Q91WU4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmco4Q91WU4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmco4Q91WU4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmco4Q91WU4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmco4Q91WU4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmco4Q91WU4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmco4Q91WU4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmco4Q91WU4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmco4Q91WU4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmco4Q91WU4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmco4Q91WU4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmco4Q91WU4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmco4Q91WU4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmco4Q91WU4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmco4Q91WU4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmco4Q91WU4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmco4Q91WU4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmco4Q91WU4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmco4Q91WU4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmco4Q91WU4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmco4Q91WU4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmco4Q91WU4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmco4Q91WU4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmco4Q91WU4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmco4Q91WU4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmco4Q91WU4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmco4Q91WU4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmco4Q91WU4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmco4Q91WU4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmco4Q91WU4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmco4Q91WU4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmco4Q91WU4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmco4Q91WU4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmco4Q91WU4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmco4Q91WU4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmco4Q91WU4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmco4Q91WU4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmco4Q91WU4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmco4Q91WU4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmco4Q91WU4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmco4Q91WU4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmco4Q91WU4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmco4Q91WU4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmco4Q91WU4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmco4Q91WU4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmco4Q91WU4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmco4Q91WU4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmco4Q91WU4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmco4Q91WU4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmco4Q91WU4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmco4Q91WU4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmco4Q91WU4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmco4Q91WU4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmco4Q91WU4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmco4Q91WU4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmco4Q91WU4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmco4Q91WU4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmco4Q91WU4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmco4Q91WU4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms