Protein–RNA interactions for Protein: Q91WG3

Trub2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Trub2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trub2Q91WG3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trub2Q91WG3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trub2Q91WG3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trub2Q91WG3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trub2Q91WG3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trub2Q91WG3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trub2Q91WG3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trub2Q91WG3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trub2Q91WG3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trub2Q91WG3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trub2Q91WG3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trub2Q91WG3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trub2Q91WG3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trub2Q91WG3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trub2Q91WG3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trub2Q91WG3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trub2Q91WG3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trub2Q91WG3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trub2Q91WG3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trub2Q91WG3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Trub2Q91WG3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trub2Q91WG3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trub2Q91WG3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trub2Q91WG3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trub2Q91WG3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Trub2Q91WG3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trub2Q91WG3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trub2Q91WG3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trub2Q91WG3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trub2Q91WG3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trub2Q91WG3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trub2Q91WG3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trub2Q91WG3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trub2Q91WG3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trub2Q91WG3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trub2Q91WG3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trub2Q91WG3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trub2Q91WG3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trub2Q91WG3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trub2Q91WG3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trub2Q91WG3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trub2Q91WG3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trub2Q91WG3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trub2Q91WG3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trub2Q91WG3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trub2Q91WG3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trub2Q91WG3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trub2Q91WG3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trub2Q91WG3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trub2Q91WG3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trub2Q91WG3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trub2Q91WG3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trub2Q91WG3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trub2Q91WG3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trub2Q91WG3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trub2Q91WG3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trub2Q91WG3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trub2Q91WG3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trub2Q91WG3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trub2Q91WG3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trub2Q91WG3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trub2Q91WG3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trub2Q91WG3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trub2Q91WG3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trub2Q91WG3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trub2Q91WG3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trub2Q91WG3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trub2Q91WG3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trub2Q91WG3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trub2Q91WG3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trub2Q91WG3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trub2Q91WG3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Trub2Q91WG3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trub2Q91WG3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trub2Q91WG3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trub2Q91WG3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Trub2Q91WG3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trub2Q91WG3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trub2Q91WG3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trub2Q91WG3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trub2Q91WG3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trub2Q91WG3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trub2Q91WG3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trub2Q91WG3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Trub2Q91WG3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Trub2Q91WG3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trub2Q91WG3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trub2Q91WG3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trub2Q91WG3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trub2Q91WG3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trub2Q91WG3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trub2Q91WG3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trub2Q91WG3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trub2Q91WG3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trub2Q91WG3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trub2Q91WG3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trub2Q91WG3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trub2Q91WG3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Trub2Q91WG3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trub2Q91WG3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms