Protein–RNA interactions for Protein: Q91WD4

UPF0415 protein C7orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q91WD4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q91WD4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q91WD4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q91WD4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q91WD4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q91WD4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q91WD4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q91WD4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q91WD4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q91WD4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q91WD4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q91WD4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q91WD4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q91WD4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q91WD4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q91WD4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q91WD4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Q91WD4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q91WD4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q91WD4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q91WD4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Q91WD4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q91WD4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q91WD4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q91WD4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q91WD4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q91WD4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q91WD4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q91WD4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q91WD4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q91WD4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q91WD4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q91WD4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q91WD4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q91WD4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q91WD4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q91WD4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q91WD4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q91WD4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q91WD4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q91WD4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q91WD4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q91WD4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Q91WD4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q91WD4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q91WD4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q91WD4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q91WD4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q91WD4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q91WD4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q91WD4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q91WD4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q91WD4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q91WD4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q91WD4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q91WD4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q91WD4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q91WD4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q91WD4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q91WD4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Q91WD4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q91WD4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q91WD4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q91WD4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q91WD4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q91WD4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q91WD4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q91WD4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q91WD4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q91WD4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q91WD4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q91WD4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q91WD4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q91WD4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q91WD4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q91WD4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q91WD4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q91WD4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Q91WD4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q91WD4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q91WD4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q91WD4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q91WD4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q91WD4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q91WD4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q91WD4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q91WD4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q91WD4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q91WD4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q91WD4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q91WD4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q91WD4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q91WD4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q91WD4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q91WD4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q91WD4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q91WD4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q91WD4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q91WD4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q91WD4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms