Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csde1Q91W50 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csde1Q91W50 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csde1Q91W50 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csde1Q91W50 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csde1Q91W50 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csde1Q91W50 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csde1Q91W50 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csde1Q91W50 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csde1Q91W50 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Csde1Q91W50 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Csde1Q91W50 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Csde1Q91W50 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Csde1Q91W50 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Csde1Q91W50 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Csde1Q91W50 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csde1Q91W50 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Csde1Q91W50 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Csde1Q91W50 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csde1Q91W50 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csde1Q91W50 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csde1Q91W50 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Csde1Q91W50 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Csde1Q91W50 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Csde1Q91W50 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Csde1Q91W50 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Csde1Q91W50 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms