Protein–RNA interactions for Protein: Q91V98

Cd248, Endosialin, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd248Q91V98 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cd248Q91V98 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cd248Q91V98 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cd248Q91V98 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cd248Q91V98 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cd248Q91V98 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cd248Q91V98 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cd248Q91V98 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cd248Q91V98 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cd248Q91V98 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cd248Q91V98 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cd248Q91V98 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cd248Q91V98 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cd248Q91V98 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cd248Q91V98 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cd248Q91V98 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cd248Q91V98 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cd248Q91V98 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cd248Q91V98 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cd248Q91V98 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cd248Q91V98 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cd248Q91V98 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cd248Q91V98 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Cd248Q91V98 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cd248Q91V98 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cd248Q91V98 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cd248Q91V98 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cd248Q91V98 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cd248Q91V98 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cd248Q91V98 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cd248Q91V98 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cd248Q91V98 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cd248Q91V98 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cd248Q91V98 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cd248Q91V98 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cd248Q91V98 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cd248Q91V98 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cd248Q91V98 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cd248Q91V98 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cd248Q91V98 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cd248Q91V98 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cd248Q91V98 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cd248Q91V98 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cd248Q91V98 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cd248Q91V98 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cd248Q91V98 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cd248Q91V98 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cd248Q91V98 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cd248Q91V98 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cd248Q91V98 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cd248Q91V98 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cd248Q91V98 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cd248Q91V98 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cd248Q91V98 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cd248Q91V98 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cd248Q91V98 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cd248Q91V98 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cd248Q91V98 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cd248Q91V98 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cd248Q91V98 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cd248Q91V98 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cd248Q91V98 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cd248Q91V98 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cd248Q91V98 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cd248Q91V98 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cd248Q91V98 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cd248Q91V98 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cd248Q91V98 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cd248Q91V98 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cd248Q91V98 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cd248Q91V98 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cd248Q91V98 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cd248Q91V98 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cd248Q91V98 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cd248Q91V98 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cd248Q91V98 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cd248Q91V98 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cd248Q91V98 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cd248Q91V98 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cd248Q91V98 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cd248Q91V98 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cd248Q91V98 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cd248Q91V98 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cd248Q91V98 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cd248Q91V98 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cd248Q91V98 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cd248Q91V98 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cd248Q91V98 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cd248Q91V98 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cd248Q91V98 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cd248Q91V98 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cd248Q91V98 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Cd248Q91V98 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cd248Q91V98 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cd248Q91V98 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cd248Q91V98 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cd248Q91V98 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cd248Q91V98 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cd248Q91V98 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cd248Q91V98 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms