Protein–RNA interactions for Protein: Q91V80

Apof, Apolipoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApofQ91V80 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ApofQ91V80 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ApofQ91V80 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ApofQ91V80 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ApofQ91V80 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ApofQ91V80 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ApofQ91V80 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ApofQ91V80 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ApofQ91V80 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ApofQ91V80 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ApofQ91V80 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ApofQ91V80 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ApofQ91V80 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ApofQ91V80 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ApofQ91V80 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ApofQ91V80 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ApofQ91V80 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ApofQ91V80 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ApofQ91V80 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ApofQ91V80 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ApofQ91V80 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ApofQ91V80 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ApofQ91V80 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ApofQ91V80 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ApofQ91V80 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ApofQ91V80 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ApofQ91V80 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ApofQ91V80 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ApofQ91V80 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ApofQ91V80 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ApofQ91V80 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ApofQ91V80 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ApofQ91V80 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ApofQ91V80 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ApofQ91V80 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ApofQ91V80 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ApofQ91V80 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ApofQ91V80 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ApofQ91V80 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ApofQ91V80 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ApofQ91V80 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ApofQ91V80 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ApofQ91V80 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ApofQ91V80 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ApofQ91V80 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ApofQ91V80 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ApofQ91V80 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ApofQ91V80 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ApofQ91V80 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ApofQ91V80 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ApofQ91V80 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ApofQ91V80 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ApofQ91V80 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ApofQ91V80 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ApofQ91V80 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ApofQ91V80 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ApofQ91V80 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ApofQ91V80 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ApofQ91V80 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ApofQ91V80 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ApofQ91V80 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ApofQ91V80 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ApofQ91V80 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ApofQ91V80 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ApofQ91V80 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ApofQ91V80 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ApofQ91V80 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ApofQ91V80 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ApofQ91V80 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ApofQ91V80 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ApofQ91V80 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ApofQ91V80 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ApofQ91V80 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ApofQ91V80 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ApofQ91V80 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ApofQ91V80 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ApofQ91V80 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ApofQ91V80 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ApofQ91V80 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ApofQ91V80 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ApofQ91V80 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ApofQ91V80 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ApofQ91V80 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ApofQ91V80 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ApofQ91V80 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ApofQ91V80 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ApofQ91V80 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ApofQ91V80 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ApofQ91V80 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ApofQ91V80 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ApofQ91V80 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ApofQ91V80 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ApofQ91V80 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ApofQ91V80 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ApofQ91V80 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ApofQ91V80 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ApofQ91V80 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ApofQ91V80 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ApofQ91V80 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ApofQ91V80 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms