Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ppargc1bQ8VHJ7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ppargc1bQ8VHJ7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Ppargc1bQ8VHJ7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ppargc1bQ8VHJ7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ppargc1bQ8VHJ7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ppargc1bQ8VHJ7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms