Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SelenomQ8VHC3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SelenomQ8VHC3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SelenomQ8VHC3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SelenomQ8VHC3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SelenomQ8VHC3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SelenomQ8VHC3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SelenomQ8VHC3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SelenomQ8VHC3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SelenomQ8VHC3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SelenomQ8VHC3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SelenomQ8VHC3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SelenomQ8VHC3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SelenomQ8VHC3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SelenomQ8VHC3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SelenomQ8VHC3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SelenomQ8VHC3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SelenomQ8VHC3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SelenomQ8VHC3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SelenomQ8VHC3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SelenomQ8VHC3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SelenomQ8VHC3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SelenomQ8VHC3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SelenomQ8VHC3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SelenomQ8VHC3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SelenomQ8VHC3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SelenomQ8VHC3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SelenomQ8VHC3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SelenomQ8VHC3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SelenomQ8VHC3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SelenomQ8VHC3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SelenomQ8VHC3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SelenomQ8VHC3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SelenomQ8VHC3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SelenomQ8VHC3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SelenomQ8VHC3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SelenomQ8VHC3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SelenomQ8VHC3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SelenomQ8VHC3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SelenomQ8VHC3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SelenomQ8VHC3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SelenomQ8VHC3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SelenomQ8VHC3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SelenomQ8VHC3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SelenomQ8VHC3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SelenomQ8VHC3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SelenomQ8VHC3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SelenomQ8VHC3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SelenomQ8VHC3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SelenomQ8VHC3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SelenomQ8VHC3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SelenomQ8VHC3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SelenomQ8VHC3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms