Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU3

Apol9a, Apol9a protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9aQ8VDU3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apol9aQ8VDU3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apol9aQ8VDU3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apol9aQ8VDU3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apol9aQ8VDU3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apol9aQ8VDU3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Apol9aQ8VDU3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apol9aQ8VDU3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Apol9aQ8VDU3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Apol9aQ8VDU3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apol9aQ8VDU3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apol9aQ8VDU3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apol9aQ8VDU3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apol9aQ8VDU3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apol9aQ8VDU3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apol9aQ8VDU3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apol9aQ8VDU3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apol9aQ8VDU3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Apol9aQ8VDU3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apol9aQ8VDU3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apol9aQ8VDU3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apol9aQ8VDU3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apol9aQ8VDU3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apol9aQ8VDU3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apol9aQ8VDU3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apol9aQ8VDU3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apol9aQ8VDU3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apol9aQ8VDU3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apol9aQ8VDU3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apol9aQ8VDU3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apol9aQ8VDU3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apol9aQ8VDU3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Apol9aQ8VDU3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apol9aQ8VDU3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Apol9aQ8VDU3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apol9aQ8VDU3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apol9aQ8VDU3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apol9aQ8VDU3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apol9aQ8VDU3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apol9aQ8VDU3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apol9aQ8VDU3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apol9aQ8VDU3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apol9aQ8VDU3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apol9aQ8VDU3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apol9aQ8VDU3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apol9aQ8VDU3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apol9aQ8VDU3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apol9aQ8VDU3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apol9aQ8VDU3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apol9aQ8VDU3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apol9aQ8VDU3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apol9aQ8VDU3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apol9aQ8VDU3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apol9aQ8VDU3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apol9aQ8VDU3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Apol9aQ8VDU3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apol9aQ8VDU3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apol9aQ8VDU3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apol9aQ8VDU3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apol9aQ8VDU3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apol9aQ8VDU3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apol9aQ8VDU3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apol9aQ8VDU3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apol9aQ8VDU3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apol9aQ8VDU3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apol9aQ8VDU3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apol9aQ8VDU3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apol9aQ8VDU3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apol9aQ8VDU3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apol9aQ8VDU3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apol9aQ8VDU3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apol9aQ8VDU3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apol9aQ8VDU3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apol9aQ8VDU3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apol9aQ8VDU3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apol9aQ8VDU3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apol9aQ8VDU3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apol9aQ8VDU3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apol9aQ8VDU3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apol9aQ8VDU3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apol9aQ8VDU3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apol9aQ8VDU3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apol9aQ8VDU3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Apol9aQ8VDU3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apol9aQ8VDU3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apol9aQ8VDU3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apol9aQ8VDU3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apol9aQ8VDU3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apol9aQ8VDU3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apol9aQ8VDU3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apol9aQ8VDU3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apol9aQ8VDU3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apol9aQ8VDU3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apol9aQ8VDU3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apol9aQ8VDU3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apol9aQ8VDU3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apol9aQ8VDU3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apol9aQ8VDU3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apol9aQ8VDU3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apol9aQ8VDU3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms