Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDJ3

Hdlbp, Vigilin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HdlbpQ8VDJ3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HdlbpQ8VDJ3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HdlbpQ8VDJ3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HdlbpQ8VDJ3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HdlbpQ8VDJ3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HdlbpQ8VDJ3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HdlbpQ8VDJ3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HdlbpQ8VDJ3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HdlbpQ8VDJ3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HdlbpQ8VDJ3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HdlbpQ8VDJ3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HdlbpQ8VDJ3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HdlbpQ8VDJ3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HdlbpQ8VDJ3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HdlbpQ8VDJ3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HdlbpQ8VDJ3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HdlbpQ8VDJ3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HdlbpQ8VDJ3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HdlbpQ8VDJ3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HdlbpQ8VDJ3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HdlbpQ8VDJ3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HdlbpQ8VDJ3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HdlbpQ8VDJ3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HdlbpQ8VDJ3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HdlbpQ8VDJ3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HdlbpQ8VDJ3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HdlbpQ8VDJ3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HdlbpQ8VDJ3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HdlbpQ8VDJ3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HdlbpQ8VDJ3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HdlbpQ8VDJ3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HdlbpQ8VDJ3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HdlbpQ8VDJ3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HdlbpQ8VDJ3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HdlbpQ8VDJ3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HdlbpQ8VDJ3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HdlbpQ8VDJ3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HdlbpQ8VDJ3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HdlbpQ8VDJ3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HdlbpQ8VDJ3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HdlbpQ8VDJ3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HdlbpQ8VDJ3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HdlbpQ8VDJ3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HdlbpQ8VDJ3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HdlbpQ8VDJ3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HdlbpQ8VDJ3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HdlbpQ8VDJ3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HdlbpQ8VDJ3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HdlbpQ8VDJ3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HdlbpQ8VDJ3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HdlbpQ8VDJ3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HdlbpQ8VDJ3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HdlbpQ8VDJ3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HdlbpQ8VDJ3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HdlbpQ8VDJ3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HdlbpQ8VDJ3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HdlbpQ8VDJ3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HdlbpQ8VDJ3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HdlbpQ8VDJ3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HdlbpQ8VDJ3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HdlbpQ8VDJ3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HdlbpQ8VDJ3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HdlbpQ8VDJ3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HdlbpQ8VDJ3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HdlbpQ8VDJ3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HdlbpQ8VDJ3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HdlbpQ8VDJ3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HdlbpQ8VDJ3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HdlbpQ8VDJ3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HdlbpQ8VDJ3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HdlbpQ8VDJ3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HdlbpQ8VDJ3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HdlbpQ8VDJ3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HdlbpQ8VDJ3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HdlbpQ8VDJ3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HdlbpQ8VDJ3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HdlbpQ8VDJ3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HdlbpQ8VDJ3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HdlbpQ8VDJ3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HdlbpQ8VDJ3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HdlbpQ8VDJ3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HdlbpQ8VDJ3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HdlbpQ8VDJ3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HdlbpQ8VDJ3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HdlbpQ8VDJ3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HdlbpQ8VDJ3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HdlbpQ8VDJ3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HdlbpQ8VDJ3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HdlbpQ8VDJ3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HdlbpQ8VDJ3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HdlbpQ8VDJ3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HdlbpQ8VDJ3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HdlbpQ8VDJ3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HdlbpQ8VDJ3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HdlbpQ8VDJ3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HdlbpQ8VDJ3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HdlbpQ8VDJ3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HdlbpQ8VDJ3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HdlbpQ8VDJ3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HdlbpQ8VDJ3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms