Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDG5

Ppcs, Phosphopantothenate--cysteine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpcsQ8VDG5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PpcsQ8VDG5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PpcsQ8VDG5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PpcsQ8VDG5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PpcsQ8VDG5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PpcsQ8VDG5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PpcsQ8VDG5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PpcsQ8VDG5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PpcsQ8VDG5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PpcsQ8VDG5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PpcsQ8VDG5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PpcsQ8VDG5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PpcsQ8VDG5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PpcsQ8VDG5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PpcsQ8VDG5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PpcsQ8VDG5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PpcsQ8VDG5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PpcsQ8VDG5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PpcsQ8VDG5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PpcsQ8VDG5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PpcsQ8VDG5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PpcsQ8VDG5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PpcsQ8VDG5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PpcsQ8VDG5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PpcsQ8VDG5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PpcsQ8VDG5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PpcsQ8VDG5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PpcsQ8VDG5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PpcsQ8VDG5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PpcsQ8VDG5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PpcsQ8VDG5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PpcsQ8VDG5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PpcsQ8VDG5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PpcsQ8VDG5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms