Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC19

Alas1, 5-aminolevulinate synthase, nonspecific, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alas1Q8VC19 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Alas1Q8VC19 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Alas1Q8VC19 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Alas1Q8VC19 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Alas1Q8VC19 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Alas1Q8VC19 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Alas1Q8VC19 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Alas1Q8VC19 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Alas1Q8VC19 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Alas1Q8VC19 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Alas1Q8VC19 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Alas1Q8VC19 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Alas1Q8VC19 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Alas1Q8VC19 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Alas1Q8VC19 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Alas1Q8VC19 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Alas1Q8VC19 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Alas1Q8VC19 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Alas1Q8VC19 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Alas1Q8VC19 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Alas1Q8VC19 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Alas1Q8VC19 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Alas1Q8VC19 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Alas1Q8VC19 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Alas1Q8VC19 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Alas1Q8VC19 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Alas1Q8VC19 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Alas1Q8VC19 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Alas1Q8VC19 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Alas1Q8VC19 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Alas1Q8VC19 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Alas1Q8VC19 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Alas1Q8VC19 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Alas1Q8VC19 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Alas1Q8VC19 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Alas1Q8VC19 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Alas1Q8VC19 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Alas1Q8VC19 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Alas1Q8VC19 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Alas1Q8VC19 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Alas1Q8VC19 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Alas1Q8VC19 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Alas1Q8VC19 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Alas1Q8VC19 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Alas1Q8VC19 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Alas1Q8VC19 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Alas1Q8VC19 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Alas1Q8VC19 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Alas1Q8VC19 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Alas1Q8VC19 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Alas1Q8VC19 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Alas1Q8VC19 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Alas1Q8VC19 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Alas1Q8VC19 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Alas1Q8VC19 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Alas1Q8VC19 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Alas1Q8VC19 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Alas1Q8VC19 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Alas1Q8VC19 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Alas1Q8VC19 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Alas1Q8VC19 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Alas1Q8VC19 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Alas1Q8VC19 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Alas1Q8VC19 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Alas1Q8VC19 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Alas1Q8VC19 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Alas1Q8VC19 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Alas1Q8VC19 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Alas1Q8VC19 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Alas1Q8VC19 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Alas1Q8VC19 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Alas1Q8VC19 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Alas1Q8VC19 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Alas1Q8VC19 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Alas1Q8VC19 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Alas1Q8VC19 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Alas1Q8VC19 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Alas1Q8VC19 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Alas1Q8VC19 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Alas1Q8VC19 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Alas1Q8VC19 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Alas1Q8VC19 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Alas1Q8VC19 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Alas1Q8VC19 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Alas1Q8VC19 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Alas1Q8VC19 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Alas1Q8VC19 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Alas1Q8VC19 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Alas1Q8VC19 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Alas1Q8VC19 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Alas1Q8VC19 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Alas1Q8VC19 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Alas1Q8VC19 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Alas1Q8VC19 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Alas1Q8VC19 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Alas1Q8VC19 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Alas1Q8VC19 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Alas1Q8VC19 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Alas1Q8VC19 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Alas1Q8VC19 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms