Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Top1mtQ8R4U6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Top1mtQ8R4U6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Top1mtQ8R4U6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Top1mtQ8R4U6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Top1mtQ8R4U6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Top1mtQ8R4U6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Top1mtQ8R4U6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Top1mtQ8R4U6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Top1mtQ8R4U6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Top1mtQ8R4U6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Top1mtQ8R4U6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Top1mtQ8R4U6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Top1mtQ8R4U6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Top1mtQ8R4U6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Top1mtQ8R4U6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Top1mtQ8R4U6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Top1mtQ8R4U6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Top1mtQ8R4U6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Top1mtQ8R4U6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Top1mtQ8R4U6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Top1mtQ8R4U6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Top1mtQ8R4U6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Top1mtQ8R4U6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Top1mtQ8R4U6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Top1mtQ8R4U6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Top1mtQ8R4U6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Top1mtQ8R4U6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Top1mtQ8R4U6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Top1mtQ8R4U6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Top1mtQ8R4U6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Top1mtQ8R4U6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Top1mtQ8R4U6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Top1mtQ8R4U6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Top1mtQ8R4U6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Top1mtQ8R4U6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Top1mtQ8R4U6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Top1mtQ8R4U6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Top1mtQ8R4U6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Top1mtQ8R4U6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Top1mtQ8R4U6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Top1mtQ8R4U6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Top1mtQ8R4U6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Top1mtQ8R4U6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Top1mtQ8R4U6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Top1mtQ8R4U6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Top1mtQ8R4U6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Top1mtQ8R4U6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Top1mtQ8R4U6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Top1mtQ8R4U6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Top1mtQ8R4U6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Top1mtQ8R4U6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Top1mtQ8R4U6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Top1mtQ8R4U6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Top1mtQ8R4U6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Top1mtQ8R4U6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Top1mtQ8R4U6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Top1mtQ8R4U6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Top1mtQ8R4U6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Top1mtQ8R4U6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Top1mtQ8R4U6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Top1mtQ8R4U6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Top1mtQ8R4U6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Top1mtQ8R4U6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Top1mtQ8R4U6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Top1mtQ8R4U6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Top1mtQ8R4U6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Top1mtQ8R4U6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Top1mtQ8R4U6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Top1mtQ8R4U6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Top1mtQ8R4U6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Top1mtQ8R4U6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Top1mtQ8R4U6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Top1mtQ8R4U6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Top1mtQ8R4U6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Top1mtQ8R4U6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Top1mtQ8R4U6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Top1mtQ8R4U6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Top1mtQ8R4U6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Top1mtQ8R4U6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Top1mtQ8R4U6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Top1mtQ8R4U6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Top1mtQ8R4U6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Top1mtQ8R4U6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Top1mtQ8R4U6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Top1mtQ8R4U6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Top1mtQ8R4U6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Top1mtQ8R4U6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Top1mtQ8R4U6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Top1mtQ8R4U6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Top1mtQ8R4U6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Top1mtQ8R4U6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Top1mtQ8R4U6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Top1mtQ8R4U6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Top1mtQ8R4U6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Top1mtQ8R4U6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Top1mtQ8R4U6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Top1mtQ8R4U6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Top1mtQ8R4U6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Top1mtQ8R4U6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
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