Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4R6

Nup35, Nucleoporin NUP53, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup35Q8R4R6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup35Q8R4R6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nup35Q8R4R6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nup35Q8R4R6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup35Q8R4R6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup35Q8R4R6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup35Q8R4R6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup35Q8R4R6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup35Q8R4R6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup35Q8R4R6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup35Q8R4R6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms