Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4C2

Rufy2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy2Q8R4C2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rufy2Q8R4C2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rufy2Q8R4C2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rufy2Q8R4C2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rufy2Q8R4C2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rufy2Q8R4C2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rufy2Q8R4C2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Rufy2Q8R4C2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rufy2Q8R4C2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rufy2Q8R4C2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rufy2Q8R4C2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rufy2Q8R4C2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rufy2Q8R4C2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rufy2Q8R4C2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rufy2Q8R4C2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rufy2Q8R4C2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rufy2Q8R4C2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Rufy2Q8R4C2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rufy2Q8R4C2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rufy2Q8R4C2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rufy2Q8R4C2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rufy2Q8R4C2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rufy2Q8R4C2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rufy2Q8R4C2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rufy2Q8R4C2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rufy2Q8R4C2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rufy2Q8R4C2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rufy2Q8R4C2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rufy2Q8R4C2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rufy2Q8R4C2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rufy2Q8R4C2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rufy2Q8R4C2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rufy2Q8R4C2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rufy2Q8R4C2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rufy2Q8R4C2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rufy2Q8R4C2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rufy2Q8R4C2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rufy2Q8R4C2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rufy2Q8R4C2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Rufy2Q8R4C2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rufy2Q8R4C2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rufy2Q8R4C2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rufy2Q8R4C2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rufy2Q8R4C2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rufy2Q8R4C2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rufy2Q8R4C2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rufy2Q8R4C2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rufy2Q8R4C2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rufy2Q8R4C2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rufy2Q8R4C2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rufy2Q8R4C2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Rufy2Q8R4C2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rufy2Q8R4C2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rufy2Q8R4C2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rufy2Q8R4C2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rufy2Q8R4C2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rufy2Q8R4C2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rufy2Q8R4C2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rufy2Q8R4C2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Rufy2Q8R4C2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rufy2Q8R4C2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rufy2Q8R4C2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rufy2Q8R4C2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rufy2Q8R4C2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rufy2Q8R4C2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rufy2Q8R4C2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rufy2Q8R4C2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rufy2Q8R4C2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rufy2Q8R4C2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rufy2Q8R4C2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Rufy2Q8R4C2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rufy2Q8R4C2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rufy2Q8R4C2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rufy2Q8R4C2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rufy2Q8R4C2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rufy2Q8R4C2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rufy2Q8R4C2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rufy2Q8R4C2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rufy2Q8R4C2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rufy2Q8R4C2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rufy2Q8R4C2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rufy2Q8R4C2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rufy2Q8R4C2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Rufy2Q8R4C2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rufy2Q8R4C2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rufy2Q8R4C2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rufy2Q8R4C2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rufy2Q8R4C2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rufy2Q8R4C2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rufy2Q8R4C2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rufy2Q8R4C2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rufy2Q8R4C2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rufy2Q8R4C2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rufy2Q8R4C2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rufy2Q8R4C2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rufy2Q8R4C2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rufy2Q8R4C2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rufy2Q8R4C2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rufy2Q8R4C2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rufy2Q8R4C2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms