Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc12Q8R344 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc12Q8R344 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc12Q8R344 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc12Q8R344 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc12Q8R344 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc12Q8R344 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc12Q8R344 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc12Q8R344 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc12Q8R344 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc12Q8R344 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc12Q8R344 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc12Q8R344 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc12Q8R344 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc12Q8R344 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc12Q8R344 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc12Q8R344 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc12Q8R344 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc12Q8R344 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc12Q8R344 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc12Q8R344 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc12Q8R344 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc12Q8R344 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc12Q8R344 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc12Q8R344 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc12Q8R344 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc12Q8R344 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc12Q8R344 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc12Q8R344 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc12Q8R344 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc12Q8R344 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc12Q8R344 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc12Q8R344 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc12Q8R344 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc12Q8R344 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc12Q8R344 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc12Q8R344 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc12Q8R344 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc12Q8R344 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc12Q8R344 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc12Q8R344 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc12Q8R344 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc12Q8R344 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc12Q8R344 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc12Q8R344 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc12Q8R344 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc12Q8R344 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc12Q8R344 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc12Q8R344 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc12Q8R344 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc12Q8R344 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc12Q8R344 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc12Q8R344 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc12Q8R344 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc12Q8R344 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc12Q8R344 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc12Q8R344 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc12Q8R344 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc12Q8R344 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc12Q8R344 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc12Q8R344 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc12Q8R344 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc12Q8R344 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc12Q8R344 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc12Q8R344 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc12Q8R344 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc12Q8R344 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc12Q8R344 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc12Q8R344 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc12Q8R344 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc12Q8R344 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc12Q8R344 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc12Q8R344 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc12Q8R344 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc12Q8R344 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc12Q8R344 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc12Q8R344 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc12Q8R344 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc12Q8R344 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc12Q8R344 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc12Q8R344 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc12Q8R344 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc12Q8R344 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc12Q8R344 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc12Q8R344 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc12Q8R344 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc12Q8R344 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc12Q8R344 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc12Q8R344 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc12Q8R344 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc12Q8R344 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc12Q8R344 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc12Q8R344 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc12Q8R344 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc12Q8R344 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc12Q8R344 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc12Q8R344 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc12Q8R344 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc12Q8R344 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc12Q8R344 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms