Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Hecw1Q8K4P8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Hecw1Q8K4P8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Hecw1Q8K4P8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Hecw1Q8K4P8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Hecw1Q8K4P8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Hecw1Q8K4P8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Hecw1Q8K4P8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Hecw1Q8K4P8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Hecw1Q8K4P8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Hecw1Q8K4P8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Hecw1Q8K4P8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Hecw1Q8K4P8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Hecw1Q8K4P8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Hecw1Q8K4P8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Hecw1Q8K4P8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Hecw1Q8K4P8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Hecw1Q8K4P8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Hecw1Q8K4P8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Hecw1Q8K4P8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Hecw1Q8K4P8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Hecw1Q8K4P8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Hecw1Q8K4P8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Hecw1Q8K4P8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Hecw1Q8K4P8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Hecw1Q8K4P8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Hecw1Q8K4P8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Hecw1Q8K4P8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Hecw1Q8K4P8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Hecw1Q8K4P8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Hecw1Q8K4P8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Hecw1Q8K4P8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Hecw1Q8K4P8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Hecw1Q8K4P8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Hecw1Q8K4P8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Hecw1Q8K4P8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Hecw1Q8K4P8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Hecw1Q8K4P8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Hecw1Q8K4P8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Hecw1Q8K4P8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Hecw1Q8K4P8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Hecw1Q8K4P8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Hecw1Q8K4P8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Hecw1Q8K4P8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Hecw1Q8K4P8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Hecw1Q8K4P8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Hecw1Q8K4P8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Hecw1Q8K4P8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Hecw1Q8K4P8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Hecw1Q8K4P8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Hecw1Q8K4P8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Hecw1Q8K4P8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Hecw1Q8K4P8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Hecw1Q8K4P8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Hecw1Q8K4P8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Hecw1Q8K4P8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Hecw1Q8K4P8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Hecw1Q8K4P8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Hecw1Q8K4P8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Hecw1Q8K4P8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Hecw1Q8K4P8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Hecw1Q8K4P8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Hecw1Q8K4P8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Hecw1Q8K4P8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Hecw1Q8K4P8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Hecw1Q8K4P8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Hecw1Q8K4P8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Hecw1Q8K4P8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Hecw1Q8K4P8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Hecw1Q8K4P8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Hecw1Q8K4P8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Hecw1Q8K4P8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Hecw1Q8K4P8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Hecw1Q8K4P8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Hecw1Q8K4P8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Hecw1Q8K4P8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Hecw1Q8K4P8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Hecw1Q8K4P8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Hecw1Q8K4P8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Hecw1Q8K4P8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Hecw1Q8K4P8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Hecw1Q8K4P8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Hecw1Q8K4P8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Hecw1Q8K4P8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Hecw1Q8K4P8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Hecw1Q8K4P8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Hecw1Q8K4P8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Hecw1Q8K4P8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Hecw1Q8K4P8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Hecw1Q8K4P8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Hecw1Q8K4P8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Hecw1Q8K4P8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Hecw1Q8K4P8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Hecw1Q8K4P8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Hecw1Q8K4P8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Hecw1Q8K4P8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Hecw1Q8K4P8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Hecw1Q8K4P8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Hecw1Q8K4P8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Hecw1Q8K4P8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms