Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4G1

Ltbp4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp4Q8K4G1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ltbp4Q8K4G1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ltbp4Q8K4G1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ltbp4Q8K4G1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ltbp4Q8K4G1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ltbp4Q8K4G1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ltbp4Q8K4G1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ltbp4Q8K4G1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ltbp4Q8K4G1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ltbp4Q8K4G1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Ltbp4Q8K4G1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ltbp4Q8K4G1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ltbp4Q8K4G1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ltbp4Q8K4G1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ltbp4Q8K4G1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ltbp4Q8K4G1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Ltbp4Q8K4G1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ltbp4Q8K4G1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Ltbp4Q8K4G1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ltbp4Q8K4G1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ltbp4Q8K4G1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ltbp4Q8K4G1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ltbp4Q8K4G1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ltbp4Q8K4G1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ltbp4Q8K4G1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ltbp4Q8K4G1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ltbp4Q8K4G1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ltbp4Q8K4G1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ltbp4Q8K4G1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ltbp4Q8K4G1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ltbp4Q8K4G1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ltbp4Q8K4G1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ltbp4Q8K4G1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ltbp4Q8K4G1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ltbp4Q8K4G1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ltbp4Q8K4G1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ltbp4Q8K4G1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ltbp4Q8K4G1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ltbp4Q8K4G1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ltbp4Q8K4G1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ltbp4Q8K4G1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ltbp4Q8K4G1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ltbp4Q8K4G1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ltbp4Q8K4G1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ltbp4Q8K4G1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Ltbp4Q8K4G1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Ltbp4Q8K4G1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ltbp4Q8K4G1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ltbp4Q8K4G1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ltbp4Q8K4G1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ltbp4Q8K4G1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ltbp4Q8K4G1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ltbp4Q8K4G1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ltbp4Q8K4G1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ltbp4Q8K4G1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ltbp4Q8K4G1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ltbp4Q8K4G1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ltbp4Q8K4G1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Ltbp4Q8K4G1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ltbp4Q8K4G1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ltbp4Q8K4G1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ltbp4Q8K4G1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Ltbp4Q8K4G1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Ltbp4Q8K4G1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Ltbp4Q8K4G1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Ltbp4Q8K4G1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Ltbp4Q8K4G1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ltbp4Q8K4G1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ltbp4Q8K4G1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ltbp4Q8K4G1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ltbp4Q8K4G1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ltbp4Q8K4G1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ltbp4Q8K4G1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ltbp4Q8K4G1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ltbp4Q8K4G1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ltbp4Q8K4G1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ltbp4Q8K4G1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ltbp4Q8K4G1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ltbp4Q8K4G1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ltbp4Q8K4G1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ltbp4Q8K4G1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ltbp4Q8K4G1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ltbp4Q8K4G1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ltbp4Q8K4G1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ltbp4Q8K4G1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ltbp4Q8K4G1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ltbp4Q8K4G1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ltbp4Q8K4G1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ltbp4Q8K4G1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ltbp4Q8K4G1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ltbp4Q8K4G1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ltbp4Q8K4G1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ltbp4Q8K4G1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ltbp4Q8K4G1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ltbp4Q8K4G1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Ltbp4Q8K4G1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ltbp4Q8K4G1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ltbp4Q8K4G1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ltbp4Q8K4G1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ltbp4Q8K4G1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms