Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
OptnQ8K3K8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
OptnQ8K3K8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
OptnQ8K3K8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
OptnQ8K3K8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
OptnQ8K3K8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
OptnQ8K3K8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
OptnQ8K3K8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
OptnQ8K3K8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
OptnQ8K3K8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
OptnQ8K3K8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
OptnQ8K3K8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
OptnQ8K3K8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
OptnQ8K3K8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
OptnQ8K3K8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
OptnQ8K3K8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
OptnQ8K3K8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
OptnQ8K3K8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
OptnQ8K3K8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
OptnQ8K3K8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
OptnQ8K3K8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
OptnQ8K3K8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
OptnQ8K3K8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
OptnQ8K3K8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
OptnQ8K3K8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
OptnQ8K3K8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
OptnQ8K3K8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
OptnQ8K3K8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
OptnQ8K3K8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
OptnQ8K3K8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
OptnQ8K3K8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
OptnQ8K3K8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
OptnQ8K3K8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
OptnQ8K3K8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
OptnQ8K3K8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
OptnQ8K3K8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
OptnQ8K3K8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
OptnQ8K3K8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
OptnQ8K3K8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
OptnQ8K3K8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
OptnQ8K3K8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
OptnQ8K3K8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
OptnQ8K3K8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
OptnQ8K3K8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
OptnQ8K3K8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
OptnQ8K3K8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
OptnQ8K3K8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
OptnQ8K3K8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
OptnQ8K3K8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
OptnQ8K3K8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
OptnQ8K3K8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
OptnQ8K3K8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
OptnQ8K3K8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
OptnQ8K3K8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
OptnQ8K3K8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
OptnQ8K3K8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
OptnQ8K3K8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
OptnQ8K3K8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
OptnQ8K3K8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
OptnQ8K3K8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
OptnQ8K3K8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
OptnQ8K3K8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
OptnQ8K3K8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
OptnQ8K3K8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
OptnQ8K3K8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
OptnQ8K3K8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
OptnQ8K3K8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
OptnQ8K3K8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
OptnQ8K3K8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
OptnQ8K3K8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
OptnQ8K3K8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
OptnQ8K3K8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
OptnQ8K3K8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
OptnQ8K3K8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
OptnQ8K3K8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
OptnQ8K3K8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
OptnQ8K3K8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
OptnQ8K3K8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
OptnQ8K3K8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
OptnQ8K3K8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
OptnQ8K3K8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
OptnQ8K3K8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
OptnQ8K3K8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
OptnQ8K3K8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
OptnQ8K3K8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
OptnQ8K3K8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
OptnQ8K3K8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
OptnQ8K3K8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
OptnQ8K3K8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
OptnQ8K3K8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
OptnQ8K3K8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
OptnQ8K3K8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
OptnQ8K3K8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
OptnQ8K3K8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
OptnQ8K3K8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
OptnQ8K3K8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
OptnQ8K3K8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
OptnQ8K3K8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
OptnQ8K3K8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
OptnQ8K3K8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms