Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MyripQ8K3I4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MyripQ8K3I4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MyripQ8K3I4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MyripQ8K3I4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MyripQ8K3I4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MyripQ8K3I4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MyripQ8K3I4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MyripQ8K3I4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MyripQ8K3I4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MyripQ8K3I4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MyripQ8K3I4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MyripQ8K3I4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MyripQ8K3I4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MyripQ8K3I4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MyripQ8K3I4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MyripQ8K3I4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MyripQ8K3I4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MyripQ8K3I4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MyripQ8K3I4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MyripQ8K3I4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MyripQ8K3I4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MyripQ8K3I4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MyripQ8K3I4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MyripQ8K3I4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MyripQ8K3I4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MyripQ8K3I4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MyripQ8K3I4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MyripQ8K3I4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MyripQ8K3I4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MyripQ8K3I4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MyripQ8K3I4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MyripQ8K3I4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MyripQ8K3I4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MyripQ8K3I4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MyripQ8K3I4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MyripQ8K3I4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MyripQ8K3I4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MyripQ8K3I4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MyripQ8K3I4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MyripQ8K3I4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MyripQ8K3I4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MyripQ8K3I4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MyripQ8K3I4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MyripQ8K3I4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MyripQ8K3I4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MyripQ8K3I4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MyripQ8K3I4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MyripQ8K3I4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MyripQ8K3I4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MyripQ8K3I4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MyripQ8K3I4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MyripQ8K3I4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MyripQ8K3I4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MyripQ8K3I4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MyripQ8K3I4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MyripQ8K3I4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MyripQ8K3I4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MyripQ8K3I4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MyripQ8K3I4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MyripQ8K3I4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MyripQ8K3I4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MyripQ8K3I4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MyripQ8K3I4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MyripQ8K3I4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MyripQ8K3I4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MyripQ8K3I4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MyripQ8K3I4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MyripQ8K3I4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MyripQ8K3I4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MyripQ8K3I4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MyripQ8K3I4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MyripQ8K3I4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MyripQ8K3I4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MyripQ8K3I4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MyripQ8K3I4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MyripQ8K3I4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MyripQ8K3I4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MyripQ8K3I4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MyripQ8K3I4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MyripQ8K3I4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MyripQ8K3I4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MyripQ8K3I4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MyripQ8K3I4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MyripQ8K3I4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MyripQ8K3I4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MyripQ8K3I4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MyripQ8K3I4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MyripQ8K3I4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MyripQ8K3I4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MyripQ8K3I4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MyripQ8K3I4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MyripQ8K3I4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MyripQ8K3I4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MyripQ8K3I4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MyripQ8K3I4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MyripQ8K3I4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MyripQ8K3I4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MyripQ8K3I4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MyripQ8K3I4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms