Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prpf39Q8K2Z2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prpf39Q8K2Z2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prpf39Q8K2Z2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prpf39Q8K2Z2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prpf39Q8K2Z2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prpf39Q8K2Z2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prpf39Q8K2Z2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prpf39Q8K2Z2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prpf39Q8K2Z2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prpf39Q8K2Z2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prpf39Q8K2Z2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prpf39Q8K2Z2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prpf39Q8K2Z2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prpf39Q8K2Z2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prpf39Q8K2Z2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prpf39Q8K2Z2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prpf39Q8K2Z2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prpf39Q8K2Z2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Prpf39Q8K2Z2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prpf39Q8K2Z2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prpf39Q8K2Z2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prpf39Q8K2Z2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prpf39Q8K2Z2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prpf39Q8K2Z2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prpf39Q8K2Z2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prpf39Q8K2Z2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prpf39Q8K2Z2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prpf39Q8K2Z2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prpf39Q8K2Z2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prpf39Q8K2Z2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prpf39Q8K2Z2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prpf39Q8K2Z2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Prpf39Q8K2Z2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prpf39Q8K2Z2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Prpf39Q8K2Z2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prpf39Q8K2Z2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prpf39Q8K2Z2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prpf39Q8K2Z2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prpf39Q8K2Z2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prpf39Q8K2Z2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Prpf39Q8K2Z2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prpf39Q8K2Z2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prpf39Q8K2Z2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Prpf39Q8K2Z2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prpf39Q8K2Z2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prpf39Q8K2Z2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prpf39Q8K2Z2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prpf39Q8K2Z2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prpf39Q8K2Z2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prpf39Q8K2Z2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prpf39Q8K2Z2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prpf39Q8K2Z2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prpf39Q8K2Z2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Prpf39Q8K2Z2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prpf39Q8K2Z2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prpf39Q8K2Z2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prpf39Q8K2Z2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prpf39Q8K2Z2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prpf39Q8K2Z2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prpf39Q8K2Z2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prpf39Q8K2Z2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prpf39Q8K2Z2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prpf39Q8K2Z2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prpf39Q8K2Z2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prpf39Q8K2Z2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prpf39Q8K2Z2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prpf39Q8K2Z2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prpf39Q8K2Z2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prpf39Q8K2Z2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prpf39Q8K2Z2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prpf39Q8K2Z2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prpf39Q8K2Z2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prpf39Q8K2Z2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prpf39Q8K2Z2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prpf39Q8K2Z2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prpf39Q8K2Z2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prpf39Q8K2Z2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prpf39Q8K2Z2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prpf39Q8K2Z2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prpf39Q8K2Z2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prpf39Q8K2Z2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prpf39Q8K2Z2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prpf39Q8K2Z2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prpf39Q8K2Z2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prpf39Q8K2Z2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prpf39Q8K2Z2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prpf39Q8K2Z2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prpf39Q8K2Z2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prpf39Q8K2Z2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Prpf39Q8K2Z2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prpf39Q8K2Z2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prpf39Q8K2Z2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prpf39Q8K2Z2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prpf39Q8K2Z2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Prpf39Q8K2Z2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms