Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Otud6bQ8K2H2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Otud6bQ8K2H2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Otud6bQ8K2H2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Otud6bQ8K2H2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Otud6bQ8K2H2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Otud6bQ8K2H2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Otud6bQ8K2H2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Otud6bQ8K2H2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Otud6bQ8K2H2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Otud6bQ8K2H2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Otud6bQ8K2H2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Otud6bQ8K2H2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Otud6bQ8K2H2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Otud6bQ8K2H2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Otud6bQ8K2H2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Otud6bQ8K2H2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Otud6bQ8K2H2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Otud6bQ8K2H2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Otud6bQ8K2H2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Otud6bQ8K2H2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Otud6bQ8K2H2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Otud6bQ8K2H2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Otud6bQ8K2H2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Otud6bQ8K2H2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Otud6bQ8K2H2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Otud6bQ8K2H2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Otud6bQ8K2H2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Otud6bQ8K2H2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Otud6bQ8K2H2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Otud6bQ8K2H2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Otud6bQ8K2H2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Otud6bQ8K2H2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Otud6bQ8K2H2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Otud6bQ8K2H2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Otud6bQ8K2H2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Otud6bQ8K2H2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Otud6bQ8K2H2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Otud6bQ8K2H2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Otud6bQ8K2H2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Otud6bQ8K2H2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Otud6bQ8K2H2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Otud6bQ8K2H2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Otud6bQ8K2H2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Otud6bQ8K2H2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Otud6bQ8K2H2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Otud6bQ8K2H2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Otud6bQ8K2H2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Otud6bQ8K2H2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Otud6bQ8K2H2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Otud6bQ8K2H2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Otud6bQ8K2H2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Otud6bQ8K2H2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Otud6bQ8K2H2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Otud6bQ8K2H2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Otud6bQ8K2H2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Otud6bQ8K2H2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Otud6bQ8K2H2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Otud6bQ8K2H2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Otud6bQ8K2H2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Otud6bQ8K2H2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Otud6bQ8K2H2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Otud6bQ8K2H2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Otud6bQ8K2H2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Otud6bQ8K2H2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Otud6bQ8K2H2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Otud6bQ8K2H2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Otud6bQ8K2H2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Otud6bQ8K2H2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Otud6bQ8K2H2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Otud6bQ8K2H2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Otud6bQ8K2H2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Otud6bQ8K2H2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Otud6bQ8K2H2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Otud6bQ8K2H2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Otud6bQ8K2H2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Otud6bQ8K2H2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Otud6bQ8K2H2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Otud6bQ8K2H2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Otud6bQ8K2H2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Otud6bQ8K2H2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Otud6bQ8K2H2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Otud6bQ8K2H2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Otud6bQ8K2H2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Otud6bQ8K2H2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Otud6bQ8K2H2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Otud6bQ8K2H2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Otud6bQ8K2H2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Otud6bQ8K2H2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Otud6bQ8K2H2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Otud6bQ8K2H2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Otud6bQ8K2H2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Otud6bQ8K2H2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Otud6bQ8K2H2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Otud6bQ8K2H2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Otud6bQ8K2H2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Otud6bQ8K2H2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Otud6bQ8K2H2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Otud6bQ8K2H2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Otud6bQ8K2H2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms