Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mtmr3Q8K296 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mtmr3Q8K296 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mtmr3Q8K296 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mtmr3Q8K296 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mtmr3Q8K296 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mtmr3Q8K296 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mtmr3Q8K296 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mtmr3Q8K296 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mtmr3Q8K296 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mtmr3Q8K296 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mtmr3Q8K296 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mtmr3Q8K296 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mtmr3Q8K296 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mtmr3Q8K296 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mtmr3Q8K296 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mtmr3Q8K296 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mtmr3Q8K296 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mtmr3Q8K296 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mtmr3Q8K296 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mtmr3Q8K296 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mtmr3Q8K296 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mtmr3Q8K296 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mtmr3Q8K296 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Mtmr3Q8K296 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mtmr3Q8K296 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mtmr3Q8K296 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mtmr3Q8K296 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Mtmr3Q8K296 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mtmr3Q8K296 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mtmr3Q8K296 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mtmr3Q8K296 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mtmr3Q8K296 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mtmr3Q8K296 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mtmr3Q8K296 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mtmr3Q8K296 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mtmr3Q8K296 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mtmr3Q8K296 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Mtmr3Q8K296 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mtmr3Q8K296 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mtmr3Q8K296 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mtmr3Q8K296 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mtmr3Q8K296 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mtmr3Q8K296 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mtmr3Q8K296 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mtmr3Q8K296 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mtmr3Q8K296 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mtmr3Q8K296 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Mtmr3Q8K296 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mtmr3Q8K296 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mtmr3Q8K296 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mtmr3Q8K296 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mtmr3Q8K296 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mtmr3Q8K296 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mtmr3Q8K296 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mtmr3Q8K296 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mtmr3Q8K296 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mtmr3Q8K296 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mtmr3Q8K296 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mtmr3Q8K296 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mtmr3Q8K296 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mtmr3Q8K296 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mtmr3Q8K296 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Mtmr3Q8K296 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mtmr3Q8K296 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mtmr3Q8K296 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mtmr3Q8K296 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mtmr3Q8K296 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mtmr3Q8K296 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mtmr3Q8K296 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mtmr3Q8K296 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mtmr3Q8K296 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mtmr3Q8K296 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mtmr3Q8K296 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mtmr3Q8K296 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mtmr3Q8K296 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mtmr3Q8K296 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mtmr3Q8K296 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Mtmr3Q8K296 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Mtmr3Q8K296 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mtmr3Q8K296 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mtmr3Q8K296 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mtmr3Q8K296 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mtmr3Q8K296 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mtmr3Q8K296 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mtmr3Q8K296 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mtmr3Q8K296 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mtmr3Q8K296 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mtmr3Q8K296 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mtmr3Q8K296 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mtmr3Q8K296 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mtmr3Q8K296 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mtmr3Q8K296 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mtmr3Q8K296 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mtmr3Q8K296 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mtmr3Q8K296 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mtmr3Q8K296 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mtmr3Q8K296 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mtmr3Q8K296 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mtmr3Q8K296 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms