Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim68Q8K243 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim68Q8K243 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim68Q8K243 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim68Q8K243 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim68Q8K243 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim68Q8K243 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim68Q8K243 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim68Q8K243 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim68Q8K243 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim68Q8K243 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim68Q8K243 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim68Q8K243 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim68Q8K243 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim68Q8K243 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim68Q8K243 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim68Q8K243 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim68Q8K243 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim68Q8K243 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim68Q8K243 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim68Q8K243 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim68Q8K243 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim68Q8K243 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim68Q8K243 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim68Q8K243 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim68Q8K243 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim68Q8K243 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim68Q8K243 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim68Q8K243 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim68Q8K243 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim68Q8K243 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim68Q8K243 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim68Q8K243 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim68Q8K243 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim68Q8K243 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim68Q8K243 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim68Q8K243 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim68Q8K243 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim68Q8K243 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim68Q8K243 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim68Q8K243 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim68Q8K243 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim68Q8K243 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim68Q8K243 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim68Q8K243 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim68Q8K243 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim68Q8K243 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim68Q8K243 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim68Q8K243 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim68Q8K243 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim68Q8K243 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim68Q8K243 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim68Q8K243 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim68Q8K243 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim68Q8K243 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim68Q8K243 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim68Q8K243 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim68Q8K243 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim68Q8K243 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim68Q8K243 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim68Q8K243 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim68Q8K243 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim68Q8K243 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim68Q8K243 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim68Q8K243 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim68Q8K243 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim68Q8K243 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim68Q8K243 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim68Q8K243 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim68Q8K243 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim68Q8K243 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim68Q8K243 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim68Q8K243 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim68Q8K243 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim68Q8K243 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim68Q8K243 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim68Q8K243 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim68Q8K243 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim68Q8K243 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim68Q8K243 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim68Q8K243 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim68Q8K243 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim68Q8K243 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim68Q8K243 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim68Q8K243 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim68Q8K243 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim68Q8K243 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim68Q8K243 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim68Q8K243 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim68Q8K243 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim68Q8K243 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim68Q8K243 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim68Q8K243 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim68Q8K243 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim68Q8K243 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim68Q8K243 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim68Q8K243 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim68Q8K243 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim68Q8K243 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim68Q8K243 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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