Protein–RNA interactions for Protein: Q8K221

Arfip2, Arfaptin-2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip2Q8K221 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arfip2Q8K221 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arfip2Q8K221 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arfip2Q8K221 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arfip2Q8K221 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arfip2Q8K221 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arfip2Q8K221 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arfip2Q8K221 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arfip2Q8K221 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arfip2Q8K221 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arfip2Q8K221 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arfip2Q8K221 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arfip2Q8K221 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Arfip2Q8K221 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arfip2Q8K221 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arfip2Q8K221 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arfip2Q8K221 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arfip2Q8K221 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arfip2Q8K221 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arfip2Q8K221 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arfip2Q8K221 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arfip2Q8K221 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arfip2Q8K221 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arfip2Q8K221 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arfip2Q8K221 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arfip2Q8K221 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arfip2Q8K221 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arfip2Q8K221 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arfip2Q8K221 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arfip2Q8K221 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arfip2Q8K221 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arfip2Q8K221 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arfip2Q8K221 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arfip2Q8K221 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arfip2Q8K221 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arfip2Q8K221 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arfip2Q8K221 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arfip2Q8K221 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arfip2Q8K221 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arfip2Q8K221 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arfip2Q8K221 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arfip2Q8K221 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Arfip2Q8K221 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arfip2Q8K221 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arfip2Q8K221 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arfip2Q8K221 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arfip2Q8K221 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arfip2Q8K221 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arfip2Q8K221 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arfip2Q8K221 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arfip2Q8K221 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arfip2Q8K221 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arfip2Q8K221 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arfip2Q8K221 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arfip2Q8K221 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arfip2Q8K221 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arfip2Q8K221 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arfip2Q8K221 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arfip2Q8K221 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arfip2Q8K221 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arfip2Q8K221 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arfip2Q8K221 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Arfip2Q8K221 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arfip2Q8K221 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arfip2Q8K221 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arfip2Q8K221 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arfip2Q8K221 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arfip2Q8K221 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arfip2Q8K221 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arfip2Q8K221 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arfip2Q8K221 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Arfip2Q8K221 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arfip2Q8K221 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arfip2Q8K221 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arfip2Q8K221 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arfip2Q8K221 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arfip2Q8K221 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Arfip2Q8K221 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arfip2Q8K221 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arfip2Q8K221 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arfip2Q8K221 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arfip2Q8K221 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arfip2Q8K221 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arfip2Q8K221 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arfip2Q8K221 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arfip2Q8K221 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arfip2Q8K221 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arfip2Q8K221 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Arfip2Q8K221 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arfip2Q8K221 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arfip2Q8K221 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arfip2Q8K221 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arfip2Q8K221 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arfip2Q8K221 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arfip2Q8K221 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arfip2Q8K221 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arfip2Q8K221 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arfip2Q8K221 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arfip2Q8K221 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Arfip2Q8K221 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms