Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sde2Q8K1J5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sde2Q8K1J5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sde2Q8K1J5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sde2Q8K1J5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sde2Q8K1J5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sde2Q8K1J5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sde2Q8K1J5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sde2Q8K1J5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sde2Q8K1J5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sde2Q8K1J5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sde2Q8K1J5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sde2Q8K1J5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sde2Q8K1J5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sde2Q8K1J5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sde2Q8K1J5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sde2Q8K1J5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sde2Q8K1J5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sde2Q8K1J5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sde2Q8K1J5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sde2Q8K1J5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sde2Q8K1J5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Sde2Q8K1J5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sde2Q8K1J5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sde2Q8K1J5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sde2Q8K1J5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sde2Q8K1J5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sde2Q8K1J5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sde2Q8K1J5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sde2Q8K1J5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sde2Q8K1J5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sde2Q8K1J5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sde2Q8K1J5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sde2Q8K1J5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sde2Q8K1J5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sde2Q8K1J5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sde2Q8K1J5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Sde2Q8K1J5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sde2Q8K1J5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sde2Q8K1J5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sde2Q8K1J5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sde2Q8K1J5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sde2Q8K1J5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Sde2Q8K1J5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sde2Q8K1J5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sde2Q8K1J5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sde2Q8K1J5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sde2Q8K1J5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sde2Q8K1J5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sde2Q8K1J5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sde2Q8K1J5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sde2Q8K1J5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Sde2Q8K1J5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Sde2Q8K1J5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Sde2Q8K1J5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Sde2Q8K1J5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sde2Q8K1J5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sde2Q8K1J5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Sde2Q8K1J5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sde2Q8K1J5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sde2Q8K1J5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sde2Q8K1J5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sde2Q8K1J5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Sde2Q8K1J5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sde2Q8K1J5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Sde2Q8K1J5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sde2Q8K1J5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sde2Q8K1J5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sde2Q8K1J5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sde2Q8K1J5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sde2Q8K1J5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sde2Q8K1J5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sde2Q8K1J5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sde2Q8K1J5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Sde2Q8K1J5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sde2Q8K1J5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sde2Q8K1J5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sde2Q8K1J5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Sde2Q8K1J5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sde2Q8K1J5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sde2Q8K1J5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sde2Q8K1J5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sde2Q8K1J5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sde2Q8K1J5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Sde2Q8K1J5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sde2Q8K1J5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sde2Q8K1J5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Sde2Q8K1J5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sde2Q8K1J5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sde2Q8K1J5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sde2Q8K1J5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sde2Q8K1J5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Sde2Q8K1J5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sde2Q8K1J5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sde2Q8K1J5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sde2Q8K1J5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sde2Q8K1J5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sde2Q8K1J5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sde2Q8K1J5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sde2Q8K1J5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms