Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0U3

Tmem17, Transmembrane protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem17Q8K0U3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem17Q8K0U3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem17Q8K0U3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem17Q8K0U3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem17Q8K0U3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem17Q8K0U3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem17Q8K0U3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem17Q8K0U3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem17Q8K0U3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem17Q8K0U3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem17Q8K0U3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem17Q8K0U3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem17Q8K0U3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem17Q8K0U3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem17Q8K0U3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem17Q8K0U3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem17Q8K0U3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem17Q8K0U3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem17Q8K0U3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem17Q8K0U3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem17Q8K0U3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem17Q8K0U3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem17Q8K0U3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem17Q8K0U3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem17Q8K0U3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem17Q8K0U3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem17Q8K0U3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem17Q8K0U3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem17Q8K0U3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem17Q8K0U3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem17Q8K0U3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem17Q8K0U3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem17Q8K0U3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem17Q8K0U3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem17Q8K0U3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.4 ms