Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmbrd1Q8K0B2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmbrd1Q8K0B2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmbrd1Q8K0B2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmbrd1Q8K0B2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmbrd1Q8K0B2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmbrd1Q8K0B2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmbrd1Q8K0B2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmbrd1Q8K0B2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmbrd1Q8K0B2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmbrd1Q8K0B2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmbrd1Q8K0B2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmbrd1Q8K0B2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmbrd1Q8K0B2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmbrd1Q8K0B2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmbrd1Q8K0B2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmbrd1Q8K0B2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmbrd1Q8K0B2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmbrd1Q8K0B2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmbrd1Q8K0B2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmbrd1Q8K0B2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmbrd1Q8K0B2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmbrd1Q8K0B2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmbrd1Q8K0B2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmbrd1Q8K0B2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmbrd1Q8K0B2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmbrd1Q8K0B2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmbrd1Q8K0B2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmbrd1Q8K0B2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmbrd1Q8K0B2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmbrd1Q8K0B2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmbrd1Q8K0B2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmbrd1Q8K0B2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmbrd1Q8K0B2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmbrd1Q8K0B2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmbrd1Q8K0B2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmbrd1Q8K0B2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmbrd1Q8K0B2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmbrd1Q8K0B2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmbrd1Q8K0B2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmbrd1Q8K0B2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmbrd1Q8K0B2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Lmbrd1Q8K0B2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmbrd1Q8K0B2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmbrd1Q8K0B2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmbrd1Q8K0B2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmbrd1Q8K0B2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmbrd1Q8K0B2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmbrd1Q8K0B2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmbrd1Q8K0B2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmbrd1Q8K0B2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmbrd1Q8K0B2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmbrd1Q8K0B2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmbrd1Q8K0B2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmbrd1Q8K0B2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmbrd1Q8K0B2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmbrd1Q8K0B2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmbrd1Q8K0B2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmbrd1Q8K0B2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmbrd1Q8K0B2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmbrd1Q8K0B2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmbrd1Q8K0B2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmbrd1Q8K0B2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmbrd1Q8K0B2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmbrd1Q8K0B2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmbrd1Q8K0B2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmbrd1Q8K0B2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmbrd1Q8K0B2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmbrd1Q8K0B2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmbrd1Q8K0B2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmbrd1Q8K0B2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmbrd1Q8K0B2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmbrd1Q8K0B2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmbrd1Q8K0B2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmbrd1Q8K0B2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmbrd1Q8K0B2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmbrd1Q8K0B2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmbrd1Q8K0B2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmbrd1Q8K0B2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmbrd1Q8K0B2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmbrd1Q8K0B2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmbrd1Q8K0B2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmbrd1Q8K0B2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmbrd1Q8K0B2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmbrd1Q8K0B2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmbrd1Q8K0B2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmbrd1Q8K0B2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmbrd1Q8K0B2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmbrd1Q8K0B2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmbrd1Q8K0B2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmbrd1Q8K0B2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Lmbrd1Q8K0B2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lmbrd1Q8K0B2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lmbrd1Q8K0B2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lmbrd1Q8K0B2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lmbrd1Q8K0B2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lmbrd1Q8K0B2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms