Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZP2

Syn3, Synapsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syn3Q8JZP2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syn3Q8JZP2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syn3Q8JZP2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Syn3Q8JZP2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Syn3Q8JZP2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syn3Q8JZP2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syn3Q8JZP2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Syn3Q8JZP2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syn3Q8JZP2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syn3Q8JZP2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syn3Q8JZP2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Syn3Q8JZP2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Syn3Q8JZP2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Syn3Q8JZP2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syn3Q8JZP2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Syn3Q8JZP2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syn3Q8JZP2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Syn3Q8JZP2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Syn3Q8JZP2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syn3Q8JZP2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syn3Q8JZP2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syn3Q8JZP2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syn3Q8JZP2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syn3Q8JZP2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Syn3Q8JZP2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syn3Q8JZP2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syn3Q8JZP2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syn3Q8JZP2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Syn3Q8JZP2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Syn3Q8JZP2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syn3Q8JZP2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Syn3Q8JZP2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syn3Q8JZP2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syn3Q8JZP2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syn3Q8JZP2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Syn3Q8JZP2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Syn3Q8JZP2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syn3Q8JZP2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syn3Q8JZP2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Syn3Q8JZP2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syn3Q8JZP2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syn3Q8JZP2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syn3Q8JZP2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syn3Q8JZP2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syn3Q8JZP2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syn3Q8JZP2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Syn3Q8JZP2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syn3Q8JZP2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syn3Q8JZP2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syn3Q8JZP2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syn3Q8JZP2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syn3Q8JZP2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syn3Q8JZP2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syn3Q8JZP2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syn3Q8JZP2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syn3Q8JZP2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syn3Q8JZP2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syn3Q8JZP2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syn3Q8JZP2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syn3Q8JZP2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syn3Q8JZP2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syn3Q8JZP2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syn3Q8JZP2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syn3Q8JZP2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syn3Q8JZP2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syn3Q8JZP2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syn3Q8JZP2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syn3Q8JZP2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syn3Q8JZP2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syn3Q8JZP2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syn3Q8JZP2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syn3Q8JZP2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syn3Q8JZP2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Syn3Q8JZP2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syn3Q8JZP2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syn3Q8JZP2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syn3Q8JZP2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syn3Q8JZP2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syn3Q8JZP2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syn3Q8JZP2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syn3Q8JZP2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syn3Q8JZP2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syn3Q8JZP2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syn3Q8JZP2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syn3Q8JZP2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syn3Q8JZP2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Syn3Q8JZP2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syn3Q8JZP2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syn3Q8JZP2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syn3Q8JZP2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syn3Q8JZP2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syn3Q8JZP2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syn3Q8JZP2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syn3Q8JZP2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syn3Q8JZP2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syn3Q8JZP2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syn3Q8JZP2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syn3Q8JZP2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syn3Q8JZP2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syn3Q8JZP2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms