Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TwnkQ8CIW5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TwnkQ8CIW5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TwnkQ8CIW5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TwnkQ8CIW5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TwnkQ8CIW5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TwnkQ8CIW5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TwnkQ8CIW5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TwnkQ8CIW5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TwnkQ8CIW5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TwnkQ8CIW5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TwnkQ8CIW5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TwnkQ8CIW5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TwnkQ8CIW5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TwnkQ8CIW5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TwnkQ8CIW5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TwnkQ8CIW5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TwnkQ8CIW5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TwnkQ8CIW5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TwnkQ8CIW5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TwnkQ8CIW5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TwnkQ8CIW5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TwnkQ8CIW5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TwnkQ8CIW5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TwnkQ8CIW5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TwnkQ8CIW5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TwnkQ8CIW5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TwnkQ8CIW5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TwnkQ8CIW5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TwnkQ8CIW5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TwnkQ8CIW5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TwnkQ8CIW5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TwnkQ8CIW5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TwnkQ8CIW5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TwnkQ8CIW5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TwnkQ8CIW5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TwnkQ8CIW5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TwnkQ8CIW5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TwnkQ8CIW5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TwnkQ8CIW5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TwnkQ8CIW5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TwnkQ8CIW5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TwnkQ8CIW5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TwnkQ8CIW5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TwnkQ8CIW5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TwnkQ8CIW5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TwnkQ8CIW5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TwnkQ8CIW5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TwnkQ8CIW5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TwnkQ8CIW5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TwnkQ8CIW5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TwnkQ8CIW5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TwnkQ8CIW5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TwnkQ8CIW5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TwnkQ8CIW5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TwnkQ8CIW5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TwnkQ8CIW5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TwnkQ8CIW5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TwnkQ8CIW5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TwnkQ8CIW5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TwnkQ8CIW5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TwnkQ8CIW5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TwnkQ8CIW5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TwnkQ8CIW5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TwnkQ8CIW5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TwnkQ8CIW5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TwnkQ8CIW5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TwnkQ8CIW5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TwnkQ8CIW5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TwnkQ8CIW5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TwnkQ8CIW5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TwnkQ8CIW5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TwnkQ8CIW5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TwnkQ8CIW5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TwnkQ8CIW5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TwnkQ8CIW5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TwnkQ8CIW5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TwnkQ8CIW5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TwnkQ8CIW5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TwnkQ8CIW5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TwnkQ8CIW5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TwnkQ8CIW5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TwnkQ8CIW5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TwnkQ8CIW5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TwnkQ8CIW5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TwnkQ8CIW5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TwnkQ8CIW5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TwnkQ8CIW5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TwnkQ8CIW5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TwnkQ8CIW5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TwnkQ8CIW5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TwnkQ8CIW5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TwnkQ8CIW5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TwnkQ8CIW5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TwnkQ8CIW5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TwnkQ8CIW5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TwnkQ8CIW5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TwnkQ8CIW5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TwnkQ8CIW5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TwnkQ8CIW5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms