Protein–RNA interactions for Protein: Q8CII8

Syne4, Nesprin-4, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne4Q8CII8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syne4Q8CII8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syne4Q8CII8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syne4Q8CII8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syne4Q8CII8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syne4Q8CII8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syne4Q8CII8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syne4Q8CII8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syne4Q8CII8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syne4Q8CII8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syne4Q8CII8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syne4Q8CII8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syne4Q8CII8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syne4Q8CII8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syne4Q8CII8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syne4Q8CII8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syne4Q8CII8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syne4Q8CII8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syne4Q8CII8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syne4Q8CII8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syne4Q8CII8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syne4Q8CII8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syne4Q8CII8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syne4Q8CII8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syne4Q8CII8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syne4Q8CII8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Syne4Q8CII8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syne4Q8CII8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syne4Q8CII8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syne4Q8CII8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syne4Q8CII8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syne4Q8CII8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syne4Q8CII8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syne4Q8CII8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syne4Q8CII8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syne4Q8CII8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syne4Q8CII8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Syne4Q8CII8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syne4Q8CII8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syne4Q8CII8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syne4Q8CII8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syne4Q8CII8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syne4Q8CII8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syne4Q8CII8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syne4Q8CII8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syne4Q8CII8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syne4Q8CII8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syne4Q8CII8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syne4Q8CII8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syne4Q8CII8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syne4Q8CII8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syne4Q8CII8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syne4Q8CII8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syne4Q8CII8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syne4Q8CII8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syne4Q8CII8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Syne4Q8CII8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syne4Q8CII8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syne4Q8CII8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syne4Q8CII8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syne4Q8CII8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syne4Q8CII8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syne4Q8CII8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syne4Q8CII8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syne4Q8CII8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syne4Q8CII8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syne4Q8CII8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syne4Q8CII8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syne4Q8CII8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syne4Q8CII8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Syne4Q8CII8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syne4Q8CII8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syne4Q8CII8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syne4Q8CII8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syne4Q8CII8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syne4Q8CII8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syne4Q8CII8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syne4Q8CII8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syne4Q8CII8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syne4Q8CII8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syne4Q8CII8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syne4Q8CII8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Syne4Q8CII8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syne4Q8CII8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syne4Q8CII8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syne4Q8CII8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syne4Q8CII8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syne4Q8CII8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syne4Q8CII8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syne4Q8CII8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syne4Q8CII8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syne4Q8CII8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syne4Q8CII8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syne4Q8CII8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syne4Q8CII8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syne4Q8CII8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syne4Q8CII8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syne4Q8CII8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syne4Q8CII8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syne4Q8CII8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms