Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHT1

Ngef, Ephexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgefQ8CHT1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NgefQ8CHT1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NgefQ8CHT1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NgefQ8CHT1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NgefQ8CHT1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NgefQ8CHT1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NgefQ8CHT1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NgefQ8CHT1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NgefQ8CHT1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NgefQ8CHT1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NgefQ8CHT1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NgefQ8CHT1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NgefQ8CHT1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NgefQ8CHT1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NgefQ8CHT1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NgefQ8CHT1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NgefQ8CHT1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NgefQ8CHT1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NgefQ8CHT1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NgefQ8CHT1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NgefQ8CHT1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NgefQ8CHT1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NgefQ8CHT1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NgefQ8CHT1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NgefQ8CHT1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NgefQ8CHT1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NgefQ8CHT1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NgefQ8CHT1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NgefQ8CHT1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NgefQ8CHT1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NgefQ8CHT1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NgefQ8CHT1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NgefQ8CHT1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NgefQ8CHT1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NgefQ8CHT1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NgefQ8CHT1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NgefQ8CHT1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NgefQ8CHT1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NgefQ8CHT1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NgefQ8CHT1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NgefQ8CHT1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NgefQ8CHT1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NgefQ8CHT1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
NgefQ8CHT1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NgefQ8CHT1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NgefQ8CHT1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NgefQ8CHT1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NgefQ8CHT1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NgefQ8CHT1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NgefQ8CHT1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NgefQ8CHT1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NgefQ8CHT1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NgefQ8CHT1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NgefQ8CHT1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NgefQ8CHT1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NgefQ8CHT1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NgefQ8CHT1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NgefQ8CHT1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NgefQ8CHT1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NgefQ8CHT1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NgefQ8CHT1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NgefQ8CHT1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NgefQ8CHT1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NgefQ8CHT1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NgefQ8CHT1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NgefQ8CHT1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NgefQ8CHT1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NgefQ8CHT1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NgefQ8CHT1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NgefQ8CHT1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NgefQ8CHT1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NgefQ8CHT1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NgefQ8CHT1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NgefQ8CHT1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NgefQ8CHT1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NgefQ8CHT1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NgefQ8CHT1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NgefQ8CHT1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NgefQ8CHT1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NgefQ8CHT1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
NgefQ8CHT1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NgefQ8CHT1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NgefQ8CHT1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NgefQ8CHT1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NgefQ8CHT1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NgefQ8CHT1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NgefQ8CHT1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NgefQ8CHT1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NgefQ8CHT1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NgefQ8CHT1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NgefQ8CHT1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NgefQ8CHT1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NgefQ8CHT1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NgefQ8CHT1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NgefQ8CHT1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NgefQ8CHT1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NgefQ8CHT1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NgefQ8CHT1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NgefQ8CHT1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NgefQ8CHT1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms