Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Upp2Q8CGR7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Upp2Q8CGR7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Upp2Q8CGR7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Upp2Q8CGR7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Upp2Q8CGR7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Upp2Q8CGR7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Upp2Q8CGR7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Upp2Q8CGR7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Upp2Q8CGR7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Upp2Q8CGR7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Upp2Q8CGR7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Upp2Q8CGR7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Upp2Q8CGR7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Upp2Q8CGR7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Upp2Q8CGR7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Upp2Q8CGR7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Upp2Q8CGR7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Upp2Q8CGR7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Upp2Q8CGR7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Upp2Q8CGR7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Upp2Q8CGR7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Upp2Q8CGR7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Upp2Q8CGR7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Upp2Q8CGR7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Upp2Q8CGR7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Upp2Q8CGR7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Upp2Q8CGR7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Upp2Q8CGR7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Upp2Q8CGR7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Upp2Q8CGR7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Upp2Q8CGR7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Upp2Q8CGR7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Upp2Q8CGR7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Upp2Q8CGR7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Upp2Q8CGR7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Upp2Q8CGR7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Upp2Q8CGR7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Upp2Q8CGR7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Upp2Q8CGR7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Upp2Q8CGR7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Upp2Q8CGR7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Upp2Q8CGR7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Upp2Q8CGR7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Upp2Q8CGR7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Upp2Q8CGR7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Upp2Q8CGR7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Upp2Q8CGR7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Upp2Q8CGR7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Upp2Q8CGR7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Upp2Q8CGR7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Upp2Q8CGR7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Upp2Q8CGR7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Upp2Q8CGR7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Upp2Q8CGR7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Upp2Q8CGR7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Upp2Q8CGR7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Upp2Q8CGR7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Upp2Q8CGR7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Upp2Q8CGR7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Upp2Q8CGR7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Upp2Q8CGR7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Upp2Q8CGR7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Upp2Q8CGR7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Upp2Q8CGR7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Upp2Q8CGR7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Upp2Q8CGR7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Upp2Q8CGR7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Upp2Q8CGR7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Upp2Q8CGR7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Upp2Q8CGR7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Upp2Q8CGR7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Upp2Q8CGR7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Upp2Q8CGR7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Upp2Q8CGR7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Upp2Q8CGR7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Upp2Q8CGR7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Upp2Q8CGR7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Upp2Q8CGR7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Upp2Q8CGR7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Upp2Q8CGR7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Upp2Q8CGR7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Upp2Q8CGR7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Upp2Q8CGR7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Upp2Q8CGR7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Upp2Q8CGR7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Upp2Q8CGR7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Upp2Q8CGR7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Upp2Q8CGR7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Upp2Q8CGR7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Upp2Q8CGR7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Upp2Q8CGR7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Upp2Q8CGR7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Upp2Q8CGR7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Upp2Q8CGR7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Upp2Q8CGR7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Upp2Q8CGR7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Upp2Q8CGR7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Upp2Q8CGR7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Upp2Q8CGR7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.9 ms